虚开发票案件确实涉及所得税问题，且可能从多个层面产生影响，具体分析如下：
虚开发票对所得税计算的影响
企业所得税的计税基础是应纳税所得额，即收入总额减去不征税收入、免税收入、各项扣除及允许弥补的亏损后的余额。虚开发票若被用于虚构成本、费用（如虚增采购成本、服务费用等），会直接导致应纳税所得额被人为降低，从而少缴企业所得税。例如，企业通过虚开发票虚增100万元成本，若适用25%的企业所得税税率，则可能少缴25万元税款。
个人所得税层面，若虚开发票涉及个人代开发票或个体工商户虚增成本，同样会减少应纳税所得额，影响个人所得税的计算。例如，个体工商户通过虚开发票虚增成本，可能降低经营所得，进而少缴个人所得税。
税务稽查与法律责任
税务机关在稽查中发现企业或个人虚开发票的，会依法调整应纳税所得额，要求补缴税款，并加收滞纳金（日万分之五）。若虚开发票行为被认定为偷税，根据《税收征收管理法》第六十三条，除补缴税款、滞纳金外，还可能处以不缴或少缴税款50%至5倍的罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任（如逃税罪）。
此外，虚开发票行为本身可能独立构成犯罪。根据《刑法》第二百零五条，虚开增值税专用发票或用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票的，最高可处无期徒刑；虚开普通发票（如增值税普通发票）情节严重的，也可能构成虚开发票罪，处二年以下有期徒刑、拘役或管制，并处罚金。
所得税与虚开发票的关联性认定
在司法实践中，税务机关或司法机关会通过发票流、资金流、货物流（或服务流）“三流一致”原则，结合合同、付款记录、物流单据等证据，判断虚开发票是否实际影响了所得税的计算。例如，若企业虚开发票但无真实交易，且资金回流至个人账户，可能被认定为通过虚开发票偷逃所得税；若虚开发票与真实交易部分重叠，则需区分合法与非法部分，仅对非法部分调整所得税。
总结：虚开发票案件不仅涉及增值税等流转税问题，更直接关联所得税的计算与缴纳。企业或个人若通过虚开发票虚增成本、费用，可能面临补缴税款、滞纳金、罚款，甚至刑事责任。建议严格依法开具和取得发票，避免因小失大。如有具体案件或疑问，可直接向我咨询。