同意供应商参加同一项目的不同包，在一般情况下是合法的，但具体是否合法还需结合项目性质、招标文件规定以及相关法律法规进行综合判断。以下从不同角度进行分析：
一、从项目性质与招标文件规定角度
项目性质：
- 如果项目本身允许或鼓励供应商参与多个包，例如某些大型工程项目，可能分为多个子包，每个子包都有独立的招标要求，但允许同一供应商参与多个子包的投标，那么同意供应商参加同一项目的不同包就是合法的。
招标文件规定：
- 招标文件是招标活动的法律依据，其中会明确规定供应商参与投标的资格条件、投标要求等。如果招标文件明确允许供应商参与同一项目的不同包，或者未对此作出限制性规定，那么供应商参与多个包的投标就是合法的。
- 反之，如果招标文件明确规定供应商只能参与其中一个包，或者对参与多个包有特定的限制条件（如资质要求、业绩要求等），那么供应商未经允许参与多个包就可能构成违规。
二、从相关法律法规角度
《中华人民共和国招标投标法》：
- 该法并未直接规定供应商能否参与同一项目的不同包，但强调了招标活动的公平、公正、公开原则，以及禁止串通投标、弄虚作假等违法行为。
- 如果供应商在参与多个包投标时，未违反这些原则，也未实施违法行为，那么其参与多个包投标就是合法的。
其他相关法律法规：
- 除了《招标投标法》外，还可能涉及《合同法》、《反不正当竞争法》等法律法规。这些法律法规主要关注合同的签订、履行以及市场竞争的公平性等方面。
- 在同意供应商参加同一项目不同包的情况下，只要合同签订合法、履行合规，且未破坏市场竞争的公平性，那么就是合法的。
三、实际操作中的注意事项
仔细阅读招标文件：
- 供应商在参与投标前，应仔细阅读招标文件，了解项目性质、招标要求以及参与投标的资格条件等，确保自己符合招标文件的规定。
遵守法律法规：
- 供应商在参与投标过程中，应严格遵守相关法律法规，不得实施串通投标、弄虚作假等违法行为。
保持公平竞争：
- 供应商应秉持公平竞争的原则，不得通过不正当手段获取投标优势或排挤其他供应商。
建议：在实际操作中，如果供应商对招标文件的规定或相关法律法规存在疑问，可以及时向招标人或相关部门咨询，以确保自己的投标行为合法合规。同时，如果供应商在参与多个包投标过程中遇到任何法律问题，也可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见。