工资只发半个月，在大多数情况下是不合法的。以下从多个角度为您详细分析：
一、一般情况下的不合法性
根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。同时，《工资支付暂行规定》第七条也强调，工资至少每月支付一次。若用人单位无正当理由，只发放半个月工资，即构成克扣工资，违反了上述法律规定。在此情况下，劳动者有权依法向当地人民法院申请支付令，要求用人单位支付应得的全部工资。
二、特殊情况下的合法性分析
尽管一般情况下工资只发半个月是不合法的，但在某些特殊情况下，这种做法可能不构成违法：
协商一致：
- 若用人单位与劳动者经过平等协商，达成一致意见，如劳动者因个人原因提出先领取半个月工资，且用人单位同意，此情况视为双方在自愿、平等的基础上对工资支付方式进行了变更，因此是合法的。但这种情况较为少见，且需要双方有明确的书面或口头协议。
法定扣除情形：
- 用人单位可在法律允许的范围内代扣费用，如个人所得税、社会保险费用等。但扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。若扣除后剩余工资（即半个月工资）仍不低于最低工资标准，且扣除行为符合法律规定，则此情况是合法的。不过，这并不意味着用人单位可以随意只发半个月工资，而是需要在扣除法定费用后，确保剩余工资不低于最低标准。
经营困难与工资调整：
- 企业因自然灾害、战争等非人力所能抗拒的原因无法按时支付工资，或因生产经营困难、资金周转受影响而暂时延期支付工资（最长不得超过30日），并在征得本单位工会同意后与劳动者协商一致，先发放半个月工资，待经营状况好转后再补发剩余部分，此情况在法律允许范围内。但这种情况需要满足多个条件，包括不可抗力、经营困难、工会同意、协商一致等，且延期支付的时间有限制。
三、劳动者权益保护与用人单位责任
劳动者权益保护：
- 劳动者在遭遇工资未足额支付时，应积极维护自己的合法权益。除了向法院申请支付令外，还可以向劳动监察部门举报，要求用人单位支付应得的全部工资。
- 辞职时，劳动者有权要求用人单位支付全部应得工资；若被拒绝，可通过法律途径追究其法律责任。
用人单位责任与后果：
- 用人单位应严格遵守国家法律法规，按时足额支付工资。若未按照劳动合同约定或国家规定及时足额支付劳动报酬，劳动行政部门可责令其限期支付，并可能要求其支付赔偿金。
- 根据《劳动保障监察条例》第二十六条，用人单位克扣或者无故拖欠劳动者工资报酬的，由劳动保障行政部门责令限期支付，并可能面临加付赔偿金的处罚。
总结与建议：工资只发半个月在大多数情况下是不合法的，劳动者应了解自己的权益并采取相应措施维护自身合法权益。若您遇到此类情况，建议先与用人单位协商，若协商无果，可向劳动监察部门举报或向法院申请支付令。同时，用人单位也应严格遵守相关法律法规，确保按时足额支付劳动者工资，以避免不必要的法律纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。