公司经营困难扣绩效工资是否合法，需分情况讨论：

1. 若劳动合同或公司规章制度中有明确约定：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，用人单位与劳动者应当遵循合法、公平、平等自愿、协商一致的原则订立劳动合同。若劳动合同中明确约定了绩效工资的发放条件、标准及调整机制，且公司规章制度中也对此有详细规定，同时这些规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司在经营困难时，按照约定或规定扣减绩效工资，可能是合法的。但前提是，公司必须确保这些规定已经向劳动者进行了公示或告知，且劳动者对此无异议。

2. 若劳动合同或公司规章制度中无明确约定：

   • 在这种情况下，公司单方面扣减绩效工资可能缺乏法律依据。绩效工资通常被视为劳动者劳动报酬的一部分，其发放应当遵循劳动合同的约定。若劳动合同中未对绩效工资的扣减进行约定，公司则无权单方面进行扣减。此时，劳动者有权要求公司按照原约定支付全额工资，包括绩效工资。若公司拒绝支付，劳动者可以通过劳动仲裁或诉讼等法律途径维护自己的合法权益。

额外法律建议与风险提示：

• 审查劳动合同与规章制度：劳动者在遇到公司扣减绩效工资的情况时，首先应审查自己的劳动合同及公司的规章制度，看是否有关于绩效工资扣减的明确约定。
• 与公司协商沟通：若发现公司扣减绩效工资缺乏依据，劳动者可以尝试与公司进行协商沟通，要求公司说明扣减的原因及依据，并寻求合理的解决方案。
• 寻求法律援助：若协商无果，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉，或者通过劳动仲裁、诉讼等法律途径维护自己的合法权益。在此过程中，劳动者可以寻求专业律师的帮助，以确保自己的权益得到充分保障。

可能面临的法律后果：

• 若公司违法扣减绩效工资，可能面临劳动监察部门的处罚，包括责令改正、罚款等。
• 劳动者有权要求公司支付被扣减的绩效工资，并可能要求公司支付相应的经济补偿或赔偿金。
• 在极端情况下，若公司长期违法扣减工资，劳动者还有权解除劳动合同，并要求公司支付经济补偿。

综上所述，公司经营困难时扣减绩效工资是否合法，取决于劳动合同及公司规章制度中的约定。若您遇到此类问题，建议直接向我咨询，以便根据您的具体情况提供更详细的法律建议。