分房协议有村里盖章是否有效需分情况讨论，具体如下：

1. 协议内容合法合规且程序正当
   若分房协议内容符合《民法典》关于民事法律行为效力的规定（如双方真实意思表示、不违反法律强制性规定、不违背公序良俗），且盖章程序符合村集体组织章程（如经村民会议或村民代表会议决议、盖章人员有合法授权），则协议有效。此时村里盖章可视为村集体对协议内容的确认，具有证明力。

2. 协议内容或程序存在瑕疵

   • 内容违法：若协议涉及非法占用土地、违反宅基地分配政策（如非本村集体成员违规分房）、损害第三方合法权益等，即使盖章也无效。
     
   • 程序违法：若盖章未经法定程序（如未召开村民会议、未履行公示手续、盖章人员越权等），可能因“程序瑕疵”被撤销或确认无效。
     
   • 主体不适格：若分房主体非村集体组织（如个人私自分房），或盖章单位非村集体合法主体（如村委会已撤销但未更新公章），协议可能因主体问题无效。

3. 特殊情形：表见代理或追认
   若盖章人员虽无明确授权，但相对方有理由相信其有代理权（如长期负责村务、持有公章），且村集体事后追认，协议可能被认定为有效。但此类情形需结合具体证据判断。

建议：

• 签订分房协议前，务必核实协议内容是否符合土地管理法、宅基地使用规定等法律法规；
  
• 要求村集体按章程履行决议程序，并留存会议记录、公示照片等证据；
  
• 若对协议效力存疑，可要求村集体出具书面说明或咨询律师审查协议条款。
  

如有具体协议内容或分房背景，可进一步向我说明，我会结合细节为您分析。