在刑事案件中，若公诉机关指控的事实不成立但存在其他犯罪事实，法院通常不会直接建议公诉机关变更指控，而是会依据审理查明的事实，依法作出相应的判决或裁定。以下是对此问题的详细分析：

一、法院的职责与权力

法院在刑事案件中的主要职责是审理案件，根据事实和法律作出公正的判决。法院有权对公诉机关指控的犯罪事实进行审查，并判断其是否成立。如果法院认为公诉机关指控的犯罪事实不成立，它不会直接建议公诉机关变更指控，因为这不是法院的职责范围。法院的权力在于根据审理查明的事实，依法对被告人作出有罪或无罪的判决，或者对指控的罪名、量刑等提出调整意见（在量刑规范化改革的背景下，法院可以在量刑方面提出更具体的建议，但这并不等同于建议变更指控）。

二、公诉机关的职责与权力

公诉机关（即检察院）在刑事案件中负责提起公诉，指控被告人犯有某种罪行。公诉机关有权根据案件证据和法律规定，决定指控的罪名和犯罪事实。如果法院在审理过程中发现公诉机关指控的犯罪事实不成立，但存在其他犯罪事实，公诉机关可以根据法院的审理意见和新的证据，自行决定是否变更指控或补充起诉。这是公诉机关的职权范围，法院不会直接干预。

三、法院的处理方式

1. 如果法院认为公诉机关指控的犯罪事实不成立，但存在其他犯罪事实：

   • 法院会依据审理查明的事实，对被告人作出相应的判决。如果其他犯罪事实构成犯罪，法院会依法判处被告人有罪，并确定相应的刑罚。
   • 如果公诉机关未就其他犯罪事实提起公诉，法院通常不会直接对未指控的犯罪事实进行审理和判决。但法院可以在判决书中指出其他犯罪事实的存在，并建议公诉机关进行补充起诉或采取其他法律措施。不过，这种“建议”并非法院的法定义务，且不具有强制力。

2. 如果公诉机关根据法院的审理意见或新的证据，决定变更指控或补充起诉：

   • 法院会重新组织开庭审理，对变更后的指控或补充起诉的事实进行审查。
   • 法院会根据新的审理情况，依法作出判决或裁定。

四、法律依据与实务操作

• 法律依据：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，法院在审理案件时，应当以事实为依据，以法律为准绳。法院有权对公诉机关指控的犯罪事实进行审查，并判断其是否成立。但法院无权直接建议公诉机关变更指控，因为这属于公诉机关的职权范围。
• 实务操作：在实务中，如果法院发现公诉机关指控的犯罪事实不成立但存在其他犯罪事实，通常会通过判决书或裁定书的形式，对审理查明的事实进行客观描述，并依法作出判决。如果法院认为有必要，可以在判决书中提出对其他犯罪事实的处理建议，但这种建议不具有强制力，公诉机关可以自行决定是否采纳。

总结来说，法院在刑事案件中不会直接建议公诉机关变更指控，而是会依据审理查明的事实，依法作出相应的判决或裁定。如果公诉机关认为有必要变更指控或补充起诉，可以自行决定并采取相应的法律措施。如果您在刑事案件方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。