结论：生效6年的调解书在申请再审因超期限被驳回后，一般情况下难以直接推翻，但存在特定情形下仍可能通过其他法律途径寻求救济。以下从不同角度进行分析：
一、再审申请被驳回的常规情况
根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释的规定，当事人对已经发生法律效力的调解书，提出证据证明调解违反自愿原则或者调解协议的内容违反法律的，可以申请再审。然而，再审申请必须在法定期限内提出，通常为调解书生效后六个月内。若因超期限而被驳回再审申请，这通常意味着当事人已丧失了通过再审程序直接推翻调解书的法律机会。
二、特定情形下的救济途径
尽管再审申请被驳回后直接推翻调解书的难度较大，但在以下特定情形下，当事人仍可能寻求其他法律救济：
发现新证据：
- 若当事人在再审申请被驳回后，发现了新的证据，且该证据足以证明原调解书存在错误或违反自愿原则、法律规定，那么当事人可以尝试通过其他法律程序（如提起新的诉讼或申请检察院抗诉等）来寻求救济。但需注意，新证据的发现和提出需符合法律规定的条件和程序。
调解书存在严重违法情形：
- 如果调解书的内容严重违反法律、行政法规的强制性规定，或者损害国家利益、社会公共利益，那么即使再审申请被驳回，当事人仍有可能通过向检察院申请检察建议或抗诉等方式，促使法院对调解书进行审查并可能撤销或变更。但这一途径的成功率取决于具体案情和法律适用。
法院自身错误或程序违法：
- 若当事人认为法院在调解过程中存在严重程序违法或错误，导致调解书内容不公，且该错误或违法情形在再审申请时未被发现或未被充分论证，那么当事人可以考虑通过向上级法院申诉、反映情况等方式，寻求上级法院的监督和纠正。但这一途径通常较为复杂且成功率不高。
三、法律建议
仔细审查调解书及再审驳回裁定：
- 当事人应仔细审查调解书的内容以及再审驳回裁定，明确驳回的具体理由和法律依据，以便确定是否有可能通过其他途径寻求救济。
咨询专业律师：
- 鉴于法律程序的复杂性和专业性，建议当事人咨询专业律师，以便更准确地评估自身情况，制定合适的法律策略。
考虑其他纠纷解决方式：
- 若直接推翻调解书的难度较大，当事人可以考虑通过协商、调解等其他纠纷解决方式，寻求双方都能接受的解决方案。
最后，生效6年的调解书在申请再审因超期限被驳回后，直接推翻的难度较大。但当事人仍可根据具体情况，探索其他可能的法律救济途径。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。