结论前置：事业单位医院承包合同中约定发生医疗事故以医院的发包人甲方卫健委无关，这样的条款在大多数情况下是不合法的，且可能因违反法律强制性规定而无效。以下从多个角度进行分析：
一、法律角度
合同效力与法律强制性规定：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，否则合同无效。医疗事故责任是法律规定的强制性责任，不能通过合同约定来免除或转移。
- 医疗事故涉及患者的人身安全和健康权益，是法律重点保护的领域。因此，任何试图通过合同条款来免除或减轻医疗事故责任的约定，都可能因违反法律强制性规定而被认定为无效。
医疗事故责任主体：
- 医疗事故的责任主体通常是医疗机构及其医务人员。在承包合同中，如果承包方（即实际运营医院的一方）因管理不善或医疗行为不当导致医疗事故，那么承包方应承担相应的法律责任。
- 发包方（如卫健委）作为医院的所有者或管理者，其责任主要在于对医院的监管和管理。除非发包方在监管过程中存在过错或疏忽，否则一般不直接承担医疗事故的法律责任。但发包方不能通过合同条款来完全免除自己可能因监管不力而应承担的责任。
二、实践角度
合同条款的合理性：
- 从实践角度来看，合同条款应合理、公平地分配双方的权利和义务。试图通过合同条款来完全免除一方在医疗事故中的责任，不仅可能违反法律规定，也不符合公平原则。
- 如果合同中存在这样的条款，一旦发生医疗事故，受害者或其家属可能会依据法律规定向相关责任方（包括承包方和可能因监管不力而应承担责任的发包方）主张权利。
法律后果：
- 如果合同中的免责条款被认定为无效，那么发包方和承包方可能需要根据各自的过错程度来承担相应的法律责任。这可能导致发包方需要承担一定的经济赔偿责任或行政责任。
- 此外，如果发包方因监管不力而导致医疗事故频发，还可能面临更严重的法律后果，如被吊销医疗机构执业许可证等。
三、建议
审查合同条款：
- 在签订承包合同时，双方应仔细审查合同条款，确保合同内容合法、合规，并合理分配双方的权利和义务。
- 避免在合同中设置违反法律强制性规定的免责条款，以免引发不必要的法律纠纷。
加强监管和管理：
- 发包方应加强对承包方的监管和管理，确保承包方按照法律法规和合同约定运营医院，保障患者的人身安全和健康权益。
- 承包方也应加强内部管理，提高医疗质量和服务水平，减少医疗事故的发生。
寻求法律帮助：
- 如果双方在合同签订或履行过程中遇到法律问题或纠纷，应及时寻求专业律师的法律帮助，以便更好地维护自己的合法权益。
有问题可以直接向我咨询，我会结合你的具体情况，为你提供更详细的法律建议。