协议抚养在父亲死亡后是否有效，需分情况讨论：
若协议抚养内容不涉及父亲死亡后的抚养安排：
- 通常情况下，协议抚养是父母双方就子女抚养问题达成的约定，其效力主要及于协议双方。一旦父亲死亡，该协议中关于父亲抚养义务的部分自然无法继续履行。此时，抚养责任会依据法律规定转移至其他法定抚养人，如母亲或其他有抚养能力的亲属。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，父母对子女有抚养教育的义务。父母死亡或无力抚养的，有负担能力的祖父母、外祖父母，对于父母已经死亡或父母无力抚养的未成年孙子女、外孙子女，有抚养的义务。因此，在父亲死亡后，抚养责任会依法转移。
若协议抚养中明确约定了父亲死亡后的抚养安排：
- 如果协议中明确约定了，在父亲死亡后，子女由另一方抚养，或者由其他特定人抚养，并且该约定不违反法律、行政法规的强制性规定，也不违背公序良俗，那么该约定在父亲死亡后仍然有效。
- 实际操作：在这种情况下，协议抚养的约定可以视为父亲生前对其抚养义务的一种安排，其死亡后，该安排应得到尊重和执行。当然，如果实际抚养人因故无法继续抚养，或者抚养条件发生重大变化，也可以依法变更抚养关系。
关于协议抚养的变更与解除：
- 无论协议抚养中是否涉及父亲死亡后的抚养安排，如果在实际履行过程中出现需要变更或解除协议的情况，如抚养人经济状况发生重大变化、子女成长需求发生变化等，双方都可以协商变更或解除协议。
- 法律程序：如果协商不成，可以通过诉讼等法律途径解决。法院在审理此类案件时，会综合考虑子女的权益、双方的抚养能力和条件等因素，作出公正的裁决。
建议：
- 在签订协议抚养时，建议双方充分考虑各种可能的情况，包括一方死亡后的抚养安排，并在协议中明确约定。
- 如果协议抚养中涉及复杂的情况或条款，建议咨询专业律师，以确保协议的合法性和有效性。
- 在实际履行过程中，如果出现问题或需要变更协议，也应及时咨询律师，了解相关法律程序和注意事项。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。