针对您提出的“设施农业用地未办理备案手续如何处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确设施农业用地的性质和管理方式。设施农业用地是直接用于或者服务于农业生产的农用地，包括作物种植设施用地和畜禽水产养殖设施用地等。这类用地按农用地管理，不需办理农用地转用审批手续，但需要办理备案手续。此前政策对于占用一般耕地搞养殖项目较为宽松，由乡镇备案即可，但新政策要求更为严格，需要“批准”并符合相关标准，同时要做好进出平衡，且关键是要上图入库。

接下来，针对未办理备案手续的设施农业用地，我们根据不同情况给出处理建议：

1. 确实属于设施农业项目但未办理手续：

   • 应当责令当事人限期完善设施农用地手续，即尽快向乡镇或相关部门申请备案。
   • 如果当事人拒不办理设施农用地手续，且其附属设施用地、配套设施用地等改变了农用地性质，那么这部分用地应当属于违法建设用地，将依照《中华人民共和国土地管理法》的有关规定依法进行查处。
   • 对于未改变农用地性质的部分，则不属于违法建设用地，但仍需尽快办理备案手续以符合规定。

2. 已办理手续但附属或配套设施用地超标：

   • 如果已经办理了设施农用地使用手续，但附属设施用地、配套设施用地超过了规定的比例和面积标准，且超过部分改变了农用地性质，那么这部分用地同样属于违法建设用地。
   • 应当责令当事人限期改正，即调整附属或配套设施用地的规模和布局，以符合规定标准。
   • 如果当事人拒不改正，将按照违法用地依法进行查处。

3. 已办理手续但涉及非农业建设用地：

   • 如果已经办理了设施农用地使用手续，但设施农业项目建设中涉及了经营性粮食存储、加工和农机农资存放、维修场所，以及以农业为依托的休闲观光度假场所等非农业建设用地，且未依法办理建设用地审批手续，那么这部分用地也属于违法建设用地。
   • 应当依法进行查处，并要求当事人尽快办理相关的建设用地审批手续。

4. 以设施农业为名擅自改变用途从事非农业建设：

   • 如果有人以设施农业项目建设为名，擅自改变用途从事非农业建设占用土地，那么这种行为属于违法用地。
   • 将依据《中华人民共和国土地管理法》第七十七条规定，按非法占地行为依法严肃查处，包括责令退还非法占用的土地、限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施、恢复土地原状等措施。

综上所述，对于设施农业用地未办理备案手续的情况，我们需要根据具体情况进行区分处理，确保设施农业用地的合法合规使用。同时，也提醒广大设施农业项目业主和经营者，务必按照相关规定办理备案手续，以免引发不必要的法律风险和损失。