存在收取代理费的公司，且这类公司在合法经营的情况下是合法的。以下从多个角度为你详细分析：

合法收取代理费的公司类型及法律依据

1. 律师事务所
   • 律师事务所是专门提供法律服务的机构，其业务范围包括代理各类诉讼和非诉讼法律事务。在为客户提供法律代理服务时，律师事务所会根据案件的复杂程度、涉及标的金额大小、耗费的工作时间等因素，按照相关收费标准收取代理费。
   • 例如，在民事诉讼案件中，根据《律师服务收费管理办法》等规定，律师可以采取计件收费、按标的额比例收费或者计时收费等方式收取代理费。如果是一起简单的民间借贷纠纷案件，律师可能会按照计件收费的方式收取一定金额的代理费；而对于涉及金额较大的合同纠纷案件，则可能按照标的额的一定比例收取代理费。
2. 商标代理公司
   • 商标代理公司是专门从事商标代理业务的服务机构，其主要业务包括商标注册申请、商标变更、续展、转让、异议、撤销等。在为客户提供商标代理服务时，商标代理公司会收取相应的代理费。
   • 根据《商标代理管理办法》，商标代理机构接受委托人的委托，以委托人的名义办理商标注册申请、变更、续展、转让、异议、撤销等其他商标事宜，应当遵守法律法规和行业规范，按照规定收取代理费用。例如，企业委托商标代理公司申请注册一个商标，商标代理公司会根据商标注册的类别、数量等因素收取一定的代理费。
3. 专利代理公司
   • 专利代理公司是专门为发明人、申请人提供专利申请、专利无效宣告、专利侵权诉讼等专利相关事务代理服务的机构。在为客户提供专利代理服务时，专利代理公司会收取代理费。
   • 依据《专利代理条例》，专利代理机构接受委托，承办专利申请、专利无效宣告、专利侵权诉讼等专利事务，应当按照国家有关规定收取费用。比如，发明人委托专利代理公司申请发明专利，专利代理公司会根据专利申请的技术领域、复杂程度等因素收取代理费。

合法收取代理费公司的经营要求

1. 具备相应资质
   • 不同类型的代理公司需要具备相应的资质才能合法经营。例如，律师事务所需要取得司法行政部门颁发的执业许可证；商标代理公司需要在国家知识产权局商标局进行备案；专利代理公司需要取得专利代理机构执业许可证。
2. 遵守收费规定
   • 合法收取代理费的公司应当遵守国家有关收费的规定，不得擅自提高收费标准或者采取不正当手段收取费用。例如，商标代理公司和专利代理公司的收费标准应当符合国家知识产权局的相关规定；律师事务所的收费应当符合《律师服务收费管理办法》等规定。
3. 签订书面合同
   • 代理公司在与客户签订代理合同时，应当明确约定代理事项、代理权限、代理期限、代理费金额及支付方式等条款，以保障双方的合法权益。例如，在商标注册代理合同中，应当明确约定商标注册的类别、申请数量、代理费金额、支付时间等内容。

非法收取代理费的情况及后果

1. 无资质经营
   • 如果公司未取得相应的资质而擅自开展代理业务并收取代理费，属于非法经营行为。例如，未取得专利代理机构执业许可证的公司擅自从事专利代理业务并收取费用，将面临行政处罚，情节严重的还可能构成非法经营罪。
2. 乱收费
   • 代理公司违反国家有关收费规定，擅自提高收费标准或者采取不正当手段收取费用的，将受到相关部门的处罚。例如，律师事务所违反规定收取高额代理费，可能会被司法行政部门责令改正，给予警告、没收违法所得等处罚。

如果你在遇到涉及代理费收取的公司时，对其合法性存在疑问，或者自身在与代理公司合作过程中遇到了法律问题，都可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议。