协议征收土地设定年限是否合法，需分情况讨论：

1. 若协议征收土地用于公共利益目的，且符合法定程序：

   • 根据《中华人民共和国土地管理法》及相关法规，土地征收通常是为了公共利益的需要，如基础设施建设、公共设施建设等。在此类情况下，征收土地本身并不直接设定一个固定的“年限”，因为征收行为本身是对土地所有权的永久性转移。然而，若征收后土地用于特定项目（如临时建设项目），则可能通过规划、审批等程序设定一个使用年限，但这并非征收行为的直接结果，而是项目规划的一部分。
   • 结论：在此情况下，协议中若设定与项目规划相符的使用年限，且该年限的设定符合相关法律法规和规划要求，则是合法的。但需注意，这并非对土地所有权的年限限制，而是对土地使用权的限制。

2. 若协议征收土地用于非公共利益目的，或设定年限违反法定程序：

   • 土地征收必须严格遵循法定程序，且必须是为了公共利益的需要。若征收行为本身不符合公共利益目的，或征收程序存在违法情形（如未依法进行公告、听证、补偿等），则征收行为本身即可能被视为违法。在此情况下，协议中设定的任何年限均无法使其合法化。
   • 此外，即使征收行为合法，若协议中设定的年限违反了相关法律法规或规划要求（如超过了项目规划的使用年限），则该年限的设定也是违法的。
   • 结论：在此情况下，协议征收土地设定年限是违法的，且可能面临被撤销或确认无效的法律风险。

3. 关于协议征收土地年限的特别注意事项：

   • 协议征收土地时，双方应明确征收的目的、范围、补偿标准等关键条款，并确保这些条款符合相关法律法规和规划要求。若涉及使用年限的设定，应明确该年限的设定依据、性质（是对使用权的限制还是对所有权的限制）以及到期后的处理方式等。
   • 此外，协议征收土地时，应确保征收程序的合法性和透明性，包括依法进行公告、听证、补偿等程序，以保障被征收人的合法权益。
   • 结论：在协议征收土地时，应谨慎设定年限条款，并确保其合法性和合理性。若存在疑问或争议，建议及时咨询专业律师以获取法律意见。

法律建议：

• 在协议征收土地时，务必确保征收行为的合法性和合规性，包括征收目的、程序、补偿标准等方面。
• 若涉及使用年限的设定，应明确该年限的设定依据、性质及到期后的处理方式，并确保其符合相关法律法规和规划要求。
• 若对协议征收土地年限的合法性存在疑问或争议，建议及时咨询专业律师以获取法律意见，并避免盲目签订协议或采取其他法律行动。

可能法律后果：

• 若协议征收土地设定年限违法，则可能面临被撤销或确认无效的法律风险，导致征收行为无效或部分无效。
• 此外，违法征收行为还可能引发行政复议、行政诉讼等法律纠纷，给征收方和被征收方均带来不必要的法律风险和成本。