农民未经村集体同意栽果树的处理方式需分情况讨论，具体如下：

1. 土地权属与用途角度

   • 若农民栽种果树的土地属于村集体所有（如集体建设用地、未承包到户的荒地等），且未经村集体同意擅自改变土地用途（如将非林地改为果园），则可能违反《土地管理法》第四十四条关于“建设占用土地涉及农用地转为建设用地的，应当办理农用地转用审批手续”的规定，以及《农村土地承包法》第十八条关于“承包方承担依法保护和合理利用土地的义务”的要求。
     
   • 处理方式：村集体有权要求农民恢复土地原状，或通过协商补签承包合同、收取土地使用费；若造成损失，可要求赔偿。若涉及非法占用农用地，可能面临行政处罚（如罚款、限期拆除地上附着物）甚至刑事责任（《刑法》第三百四十二条非法占用农用地罪）。

2. 承包合同约定角度

   • 若农民已通过家庭承包方式取得土地经营权（如耕地、林地），但承包合同中明确约定“不得擅自改变土地用途”或“需经发包方同意方可种植经济作物”，则农民未经同意栽果树构成违约。
     
   • 处理方式：村集体可依据《民法典》第五百七十七条要求农民承担违约责任（如支付违约金、赔偿损失），或解除承包合同并收回土地。若合同未明确约定，则需结合土地性质和地方政策进一步判断。

3. 地方政策与村规民约角度

   • 部分地区可能出台政策鼓励或限制特定作物种植（如生态保护红线内禁止开垦果园），或村集体通过民主议定程序制定村规民约限制未经同意的种植行为。
     
   • 处理方式：若农民行为违反地方政策或村规民约，村集体可依据相关规定要求整改；但需注意，村规民约不得与法律法规冲突，否则无效。

建议行动步骤：

1. 核实土地权属与合同：农民应首先确认土地性质（如是否为承包地、是否允许种植果树）及承包合同条款；村集体应核查土地登记信息和合同约定。
   
2. 协商解决：双方可就补签协议、调整种植方案或补偿事宜进行协商，避免矛盾升级。
   
3. 行政或司法途径：若协商无果，村集体可向乡镇政府或农业农村部门举报违法行为，或通过诉讼主张权利；农民若认为村集体行为违法，亦可提起行政诉讼或民事诉讼。
   

提示：法律适用需结合具体案情和地方规定，建议双方保留土地权属证明、合同、现场照片等证据，必要时咨询专业律师以制定应对方案。