您好，关于您提出的“检察院退侦第二次后会如何处理”的问题，这是一个涉及刑事诉讼程序的重要环节，下面我将为您详细解析。
首先，我们需要明确的是，检察院在审查起诉阶段，如果认为案件证据不足或存在其他需要补充侦查的情形，是有权将案件退回公安机关进行补充侦查的，且补充侦查以二次为限。这是基于《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定。
当案件进入第二次退查阶段后，其处理方式主要取决于案件的证据情况：
若证据确凿、充分：
- 检察院在审查公安机关重新移送的案件后，如果认为犯罪事实清楚，证据确实、充分，依法应当追究刑事责任的，那么检察院将作出起诉决定，并向人民法院提起公诉。
若证据不足或存在其他法定情形：
- 法定不起诉：如果经过两次补充侦查后，发现犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或者存在《刑事诉讼法》第十六条规定的情形之一（如情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪等），那么检察院应当作出不起诉决定。
- 存疑不起诉：如果检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件，那么检察院也应当作出不起诉的决定。但需要注意的是，如果之后发现了新的证据，且符合起诉条件，检察院是可以重新提起公诉的。
- 酌定不起诉：在特定情况下，如犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，检察院也可以作出不起诉决定。
其他特殊情况：
- 在补充侦查过程中，如果发现了新的同案犯或新罪行，公安机关需要重新制作起诉意见书，并移送检察院审查。
- 如果原认定的犯罪事实有重大变化，不应追究刑事责任的，公安机关也需要重新提出处理意见，并通知退查的检察院。
此外，还有一些重要的注意事项和后续措施需要您了解：
- 立即释放：如果检察院作出了不起诉决定，且被不起诉人在押，那么应当立即释放被不起诉人。
- 复议与复核：对于不起诉的案件，如果公安机关认为不起诉决定有错误，可以要求复议；如果意见不被接受，还可以向上一级人民检察院提请复核。
- 被害人申诉：对于有被害人的案件，如果被害人对不起诉决定不服，可以向上一级人民检察院申诉，请求提起公诉。
综上所述，检察院退侦第二次后的处理方式主要取决于案件的证据情况。在大多数情况下，如果证据仍然不足或存在其他法定情形，检察院会作出不起诉的决定；如果证据确凿、充分，则会提起公诉。希望这个解答能够帮助您更好地理解这个问题。如果您还有其他疑问或需要进一步的帮助，请随时告诉我。