结论前置：员工休年假时公司扣工资既不合理也不合法，职工在年休假期间应享受与正常工作期间相同的工资收入。若用人单位扣发，职工有权采取多种措施维护自身权益。
法律背景与依据：
带薪年休假制度：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第四十五条及《职工带薪年休假条例》第二条，国家实行带薪年休假制度。职工连续工作一年以上的，享受带薪年休假。这是职工的法定权利，单位应当保证职工享受这一权益。
年休假期间的工资待遇：
- 职工在年休假期间应享受与正常工作期间相同的工资收入。这意味着，休年假时，职工的工资应照常发放，不得扣减。这是法律对职工权益的明确保护，用人单位必须遵守。
用人单位的违法责任：
- 如果用人单位扣发职工休年假期间的工资，这种行为违反了劳动法律法规的规定，属于违法行为。用人单位不仅需要补发被扣的工资，还可能面临劳动监察部门的处罚。
职工的维权途径：
与用人单位协商：
- 职工首先可以尝试与用人单位沟通，说明法律规定，要求其补发被扣工资。这是最直接、最快捷的解决方式。
向劳动监察部门投诉：
- 若协商不成，职工可以向当地劳动监察大队投诉。劳动监察部门有权对用人单位的违法行为进行查处，责令其限期支付相应工资。这是职工维护自身权益的重要途径。
申请劳动仲裁或提起诉讼：
- 如果用人单位仍然拒不支付，职工可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或者向人民法院提起诉讼，通过法律程序要求用人单位支付年假工资以及可能的赔偿金。这是职工在维权过程中的最后一道防线。
特殊情况的处理：
- 如果职工在年休假期间自愿放弃休假并提供了正常劳动，用人单位应当按照正常工资标准支付其工资，不能因未休年休假而减少工资。
- 若用人单位安排了职工休年休假，但职工因工作需要未能休假，用人单位需按照《职工带薪年休假条例》的规定，支付其未休年休假的工资报酬。
总结与建议：
- 休年假是职工的合法权益，用人单位不得扣发职工在年休假期间的工资。如遇此类情况，职工应依法维权，确保自己的合法权益得到保障。
- 同时，用人单位也应遵守相关法律法规，确保职工的带薪年休假权益得以实现。如果用人单位存在违法行为，不仅会影响职工的工作积极性和满意度，还可能面临法律处罚和声誉损失。
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