结论：客户总公司和分公司前两个合同是否可以用不同公司跟他们签，这主要取决于合同的具体内容、签订目的以及相关法律法规的规定，一般情况下是可以的，但需注意避免法律风险和合同纠纷。以下从不同角度进行分析：
一、合同主体与签订资格
总公司与分公司的法律地位：
- 总公司通常具有独立的法人资格，能够独立承担民事责任。
- 分公司则是总公司的分支机构，不具有独立的法人资格，其民事责任由总公司承担。但分公司可以在总公司的授权范围内，以自己的名义从事民事活动，包括签订合同。
签订合同的主体选择：
- 如果合同内容主要涉及总公司的业务或资产，且分公司没有相应的授权或资质，那么应当由总公司签订合同。
- 如果合同内容主要涉及分公司的业务或资产，且分公司有相应的授权或资质，那么可以由分公司签订合同。
- 在某些情况下，为了业务便利或管理需要，总公司和分公司也可以分别与同一客户签订不同的合同，但需确保合同内容不冲突，且符合相关法律法规的规定。
二、合同内容与目的
合同内容的独立性：
- 如果两个合同的内容相互独立，不互为条件或依赖，那么由不同公司签订是可行的。
- 如果两个合同的内容存在关联或互为条件，那么需要谨慎考虑是否由不同公司签订，以避免因一方违约而影响另一方的合同履行。
合同目的的实现：
- 签订合同的目的是为了实现特定的商业目标或法律义务。如果由不同公司签订合同有助于更好地实现这些目标或义务，且不会引发法律风险或合同纠纷，那么是可以考虑的。
- 但如果由不同公司签订合同可能导致合同履行困难、责任不清或法律风险增加，那么应当避免这种做法。
三、法律风险与合同纠纷
法律风险：
- 由不同公司签订合同可能增加法律风险，如合同效力问题、责任承担问题等。因此，在签订合同前，应当对相关法律法规进行充分研究，确保合同内容合法合规。
- 同时，应当明确各方的权利义务和责任承担方式，以避免在合同履行过程中出现纠纷。
合同纠纷：
- 如果由不同公司签订合同导致合同纠纷，那么需要依据合同约定和相关法律法规进行解决。这可能涉及诉讼、仲裁等法律程序，增加解决纠纷的成本和时间。
- 因此，在签订合同前，应当充分考虑可能出现的纠纷情况，并制定相应的预防措施和解决方案。
四、实际操作建议
明确合同主体：
- 在签订合同前，应当明确合同的主体是总公司还是分公司，或者是否需要由两者共同签订。
- 如果涉及分公司签订合同，应当确保分公司有相应的授权或资质，并在合同中明确其法律地位和责任承担方式。
审查合同内容：
- 仔细审查合同内容，确保合同条款清晰明确、合法合规，并符合各方的商业目标和法律义务。
- 如果合同内容存在关联或互为条件，应当考虑是否由同一公司签订或制定相应的协调机制。
咨询专业律师：
- 在签订合同前，建议咨询专业律师的意见，以确保合同内容合法合规、风险可控。
- 如果在合同履行过程中出现纠纷或问题，也应当及时寻求法律帮助和解决方案。
总结来说，客户总公司和分公司前两个合同是否可以用不同公司跟他们签，需要根据具体情况进行判断。在签订合同前，应当充分考虑合同主体、内容、目的以及法律风险等因素，并咨询专业律师的意见以确保合同合法合规、风险可控。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。