在货车超限运输且主车与挂车系不同所有人的情况下，法律责任的认定需根据具体情形进行细致分析。以下是从不同角度对这一问题的全面解答：
一、超限运输的法律责任基础
首先，需要明确的是，超限运输本身即违反了《中华人民共和国公路法》及《超限运输车辆行驶公路管理规定》等相关法律法规。无论主车与挂车是否为同一所有人，超限运输行为本身均需承担相应的法律责任，包括但不限于罚款、责令停止违法行为、恢复原状等。
二、主车与挂车不同所有人时的责任划分
共同违法行为责任：
- 若主车与挂车在超限运输过程中存在共同故意或过失，如共同策划、实施超限运输行为，则主车与挂车的所有人可能需承担连带责任。这意味着，受害方或执法机关有权要求主车或挂车的任一所有人承担全部或部分法律责任，而该所有人在承担责任后，可根据内部约定或法律规定向其他责任方追偿。
分别违法行为责任：
- 若主车与挂车在超限运输过程中各自存在独立的违法行为，如主车未超限但挂车超限，或反之，则应根据各自的违法行为分别承担责任。在此情况下，主车与挂车的所有人仅需对其自身的违法行为负责，无需对另一方的违法行为承担连带责任。
合同关系下的责任：
- 若主车与挂车之间存在租赁、挂靠等合同关系，且合同中明确约定了超限运输的责任承担方式，则应按照合同约定执行。例如，若合同中约定挂车所有人承担超限运输的全部责任，则主车所有人在承担相应责任后，有权根据合同约定向挂车所有人追偿。
三、特殊情形下的责任认定
不知情或无法控制情形：
- 若主车或挂车的所有人能够证明其对超限运输行为不知情或无法控制（如挂车被他人擅自使用进行超限运输），则可能减轻或免除其法律责任。但需注意，这种免责情形需有充分证据支持，且需符合相关法律法规的规定。
第三方过错导致超限：
- 若超限运输行为系由第三方（如装载单位、运输公司等）的过错导致，且主车与挂车的所有人已尽到合理注意义务，则主车与挂车的所有人可能无需承担法律责任或仅需承担部分责任。在此情况下，受害方或执法机关应向第三方追究责任。
四、法律建议
加强合规管理：
- 主车与挂车的所有人应加强对运输车辆的合规管理，确保车辆不超限、不超载，并定期对车辆进行安全检查和维护。
明确合同条款：
- 若主车与挂车之间存在租赁、挂靠等合同关系，应在合同中明确约定超限运输的责任承担方式，以避免未来可能出现的法律纠纷。
及时咨询专业律师：
- 在面临超限运输等法律问题时，应及时咨询专业律师，了解自身权利义务及可能面临的法律责任，以便采取合适的应对措施。
综上所述，货车超限运输且主车与挂车系不同所有人时的法律责任认定需根据具体情形进行细致分析。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。