结论：老旧小区改造水管时，1楼商铺不在改造范围是否合法，需根据具体情况判断，包括改造计划的制定依据、商铺的产权性质及改造资金的来源等。以下从不同角度进行分析：
一、改造计划的制定依据与合法性
改造计划的合法性基础：老旧小区改造通常依据地方政府的规划、政策或相关法规进行。若改造计划明确规定了改造范围，且该计划经过合法程序制定并公示，那么未将1楼商铺纳入改造范围，在计划层面可能是合法的。
改造范围的合理性：改造范围的确定应基于小区的整体需求和实际情况。若1楼商铺的水管系统与其他居民楼的水管系统相对独立，且改造其他部分不会对商铺的水管造成影响，那么未将商铺纳入改造范围可能是合理的。
二、商铺的产权性质与改造责任
产权归属：若1楼商铺为私人所有，且改造计划未涉及商铺部分，那么商铺业主可能需自行负责其水管系统的维护和改造。在此情况下，未将商铺纳入改造范围并不违法。
共有部分与专有部分：根据《民法典》的相关规定，建筑物区分所有权包括专有部分和共有部分。若商铺的水管系统属于共有部分，且改造计划未涵盖该部分，则可能涉及对共有部分管理义务的履行问题。此时，需进一步分析改造计划的合法性及商铺业主的权益保护。
三、改造资金的来源与使用
资金来源：老旧小区改造资金可能来源于政府补贴、业主自筹或社会资本投入等。若改造资金有限，且优先用于改造居民楼的水管系统，那么未将商铺纳入改造范围可能是出于资金分配的考虑。
资金使用的合规性：改造资金的使用应遵循相关法规和政策规定，确保专款专用。若改造计划明确规定了资金的使用范围，且未将商铺改造纳入其中，那么未将商铺纳入改造范围在资金使用层面可能是合规的。
四、法律建议与后续行动
了解改造计划：商铺业主应首先了解改造计划的制定依据、改造范围及资金来源等关键信息，以判断未将商铺纳入改造范围是否合法合理。
协商与沟通：若商铺业主认为改造计划不合理或侵犯了其合法权益，可与改造计划的制定方（如物业公司、居委会或政府部门）进行协商和沟通，寻求解决方案。
法律途径：若协商无果，商铺业主可考虑通过法律途径维护自身权益，如提起行政诉讼或民事诉讼等。在此过程中，建议商铺业主咨询专业律师，以获取更具体的法律建议和支持。
总结：老旧小区改造水管时，1楼商铺不在改造范围是否合法，需综合考虑改造计划的制定依据、商铺的产权性质、改造资金的来源及使用等多个因素。若商铺业主对此有疑问或认为自身权益受到侵犯，建议直接向我咨询，以便根据具体情况提供更具体的法律建议和支持。