结论：过三个月主动退回行贿金是否违纪，需结合具体情形判断，若行贿行为本身已构成违纪或违法，即便事后退回，仍可能面临纪律处分或法律责任；若行贿行为尚未构成违纪或违法，且及时退回未造成不良影响，则可能不构成违纪。以下从不同角度详细分析：
一、行贿行为本身的性质
行贿行为已构成违纪或违法：
- 法律背景：根据《中华人民共和国刑法》第三百八十九条，为谋取不正当利益，给予国家工作人员以财物的，是行贿罪。若行贿行为已达到刑事立案标准，即便事后退回行贿金，也不能改变行贿行为的违法性。
- 法律后果：行贿者可能面临刑事处罚，包括有期徒刑、拘役、罚金等。同时，根据《中国共产党纪律处分条例》等相关规定，行贿者还可能受到党纪处分，如警告、严重警告、撤销党内职务、留党察看、开除党籍等。
行贿行为尚未构成违纪或违法：
- 法律背景：若行贿行为未达到刑事立案标准，或未违反相关纪律规定，则可能不构成违纪或违法。
- 法律后果：在此情况下，若行贿者及时退回行贿金，且未造成不良影响，则可能不构成违纪。但需注意，即使不构成违纪，行贿行为本身也是不道德的，应予以谴责。
二、退回行贿金的时间与方式
退回时间：
- 及时退回：若行贿者在行贿后短时间内（如立即或数日内）意识到错误并退回行贿金，且未造成不良影响，则可能减轻或免除纪律处分或法律责任。
- 延迟退回：若行贿者延迟退回行贿金（如过三个月后），则可能被视为对行贿行为的认可或默许，从而加重纪律处分或法律责任。但具体还需结合行贿行为本身的性质、行贿金额、行贿目的等因素综合判断。
退回方式：
- 主动退回：若行贿者主动退回行贿金，并表明悔过态度，则可能在一定程度上减轻纪律处分或法律责任。
- 被动退回：若行贿者因被调查、被举报等原因而被迫退回行贿金，则可能被视为对行贿行为的掩盖或逃避，从而加重纪律处分或法律责任。
三、具体案例与法律建议
- 具体案例：假设某公职人员为谋取不正当利益，向另一公职人员行贿10万元。行贿后三个月，行贿者意识到错误并主动退回行贿金。但此时，受贿者已因受贿行为被立案侦查。在此情况下，行贿者仍可能因行贿行为面临刑事处罚和党纪处分。
- 法律建议：
- 避免行贿：首先，应坚决避免任何形式的行贿行为，遵守法律法规和道德规范。
- 及时退回：若已发生行贿行为，应立即意识到错误并尽快退回行贿金，同时向相关部门报告并表明悔过态度。
- 寻求法律帮助：若面临纪律处分或法律责任，应及时寻求专业律师的帮助，了解自身权利和义务，并积极配合调查和处理工作。
最后，过三个月主动退回行贿金是否违纪，需结合行贿行为本身的性质、退回行贿金的时间与方式等因素综合判断。若您或您身边的人面临类似问题，可直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供详细的法律建议。