行贿款通过单位退还给行贿人，这一行为是否违反纪律，需从法律与纪律两个层面进行综合分析：
法律层面：
- 行贿罪的构成：根据《中华人民共和国刑法》第三百八十九条，为谋取不正当利益，给予国家工作人员以财物的，是行贿罪。若行贿款通过单位退还，且退还行为发生在行贿行为之后，且行贿人或单位未因此获得不正当利益，那么这一退还行为本身并不直接构成行贿罪的继续或加重。但关键在于，行贿行为本身已经发生，且可能已触犯法律。
- 退还的合法性：若退还行为是基于合法、正当的理由，如行贿行为被发现后，单位主动退还行贿款以表明立场或纠正错误，且未涉及其他违法犯罪行为，那么这一退还行为在法律上可能是被允许的。然而，若退还行为是为了掩盖行贿事实、逃避法律制裁或进行其他非法活动，则可能构成新的违法犯罪行为。
纪律层面：
- 单位纪律：对于单位而言，若其涉及行贿行为，无论款项是否退还，都已违反了单位的内部纪律和规定，特别是那些对廉洁自律有明确要求的单位。退还行贿款可能是单位试图纠正错误、减轻责任的一种方式，但并不能完全消除其已违反的纪律责任。
- 党员纪律：若涉及党员领导干部，行贿行为本身即严重违反了党的政治纪律和廉洁纪律。即使行贿款通过单位退还，也不能改变行贿行为已发生的事实，因此仍可能面临党纪处分。特别是，若退还行为伴随有掩饰犯罪、对抗组织审查等情形，则更是明显违反了党的纪律。
具体分析与应用：
- 退还的动机与目的：若退还行贿款是出于真诚悔过、纠正错误的目的，且未涉及其他违法犯罪行为，那么在纪律处分上可能会考虑从轻或减轻处理。但若退还行为是为了掩盖行贿事实、逃避法律制裁或进行其他非法活动，则将面临更严厉的纪律处分。
- 退还的及时性与完整性：若退还行贿款及时且完整，表明单位或个人对错误的认识较为深刻，且愿意积极纠正错误，这在纪律处分上也是一个考虑因素。但若退还行为迟缓或不完整，则可能被视为对错误的漠视或逃避责任。
- 后续行为与态度：退还行贿款后，单位或个人的后续行为与态度也是纪律处分的重要考量。若其能够积极配合调查、主动交代问题、采取措施防止类似事件再次发生，则可能获得纪律上的宽大处理。反之，则可能面临更严厉的纪律处分。
建议与后果：
- 建议：对于涉及行贿行为的单位或个人，应尽快主动退还行贿款，并积极配合相关部门的调查与处理。同时，应深刻反思错误、加强内部管理、完善制度机制，以防止类似事件再次发生。
- 后果：若行贿行为被发现且未及时退还行贿款或退还行为存在违法犯罪情形，单位或个人将面临法律制裁和纪律处分。法律制裁可能包括罚款、没收违法所得、刑事处罚等；纪律处分则可能包括警告、记过、降级、撤职、开除等。
总之，行贿款通过单位退还给行贿人，并不能完全消除行贿行为已发生的法律事实和纪律责任。在处理此类问题时，应综合考虑法律与纪律两个层面的规定及实际情况，确保处理结果的合法性与合规性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。