司法机关的三个不起诉类型及其适用范围如下：
法定不起诉（绝对不起诉）
- 适用范围：当犯罪嫌疑人具有《刑事诉讼法》规定的特定情形之一时，人民检察院应当作出不起诉决定。这些情形具体包括：
- 情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的。例如，轻微的盗窃案件中，若盗窃金额极小，未达到立案标准，且未造成其他严重后果。
- 犯罪已过追诉时效期限的。追诉时效根据犯罪的法定最高刑确定，如某犯罪行为法定最高刑为3年有期徒刑，经过5年后即不再追诉。
- 经特赦令免除刑罚的。特赦是由国家元首或最高权力机关命令免除特定犯罪人全部或部分刑罚的制度。
- 依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的。如侮辱罪、诽谤罪等，需被害人亲自提起告诉，否则检察院应不起诉。
- 犯罪嫌疑人、被告人死亡的。一旦犯罪嫌疑人或被告人死亡，刑事诉讼程序无法继续，检察院应作出不起诉决定。
- 其他法律规定免予追究刑事责任的。如有其他法律明确规定免予追究刑事责任的情形，也应适用法定不起诉。
酌定不起诉（相对不起诉）
- 适用范围：对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。这主要包括以下情形：
- 犯罪嫌疑人在犯罪后有自首、立功等法定从轻、减轻或者免除处罚情节的。如主动投案并如实供述罪行，或积极退赃、协助抓捕其他犯罪嫌疑人等。
- 犯罪嫌疑人系未成年人，且犯罪情节较轻，具有悔罪表现等情节的。未成年人身心发育尚未成熟，对于犯罪情节较轻且有悔罪表现的未成年人，检察院可酌定不起诉。
证据不足不起诉（存疑不起诉）
- 适用范围：对于经过二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉决定。这主要适用于以下情形：
- 据以定罪的关键证据缺失。如关键证人无法找到，或关键物证灭失，导致无法形成完整的证据链条。
- 证据之间存在矛盾且无法合理排除。不同证据之间相互矛盾，且经过多次调查和补充侦查仍无法解决这些矛盾。
法律背景与建议：
不起诉制度是刑事诉讼中的一项重要制度，它体现了检察机关的裁量权和司法公正，同时也保障了犯罪嫌疑人的合法权益。在具体应用中，人民检察院会综合考虑犯罪嫌疑人的年龄、性格、情况、犯罪性质和情节、犯罪后的表现、悔罪态度以及一贯表现等因素，来决定是否不起诉。
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