若合作协议中确实没有仲裁条款，或者仲裁条款因不符合法律规定而无效，那么双方无法通过仲裁解决争议，此时可以考虑以下几种途径：
协商：
- 法律背景：协商是解决争议最直接、最经济的方式。双方可以坐下来，就争议的问题进行友好、平等的讨论，寻求双方都能接受的解决方案。
- 建议：在协商过程中，双方应保持冷静、理性，避免情绪化的争执。同时，可以邀请第三方（如行业专家、调解员等）参与协商，以提供中立的意见和建议。
调解：
- 法律背景：调解是在第三方的主持下，通过说服、疏导等方法，促使双方在平等协商基础上自愿达成调解协议，解决民间纠纷的活动。调解具有灵活性、高效性、保密性等优点。
- 建议：双方可以选择向人民调解委员会、行业调解组织等申请调解。在调解过程中，双方应积极配合调解员的工作，如实陈述事实，提供证据，并尊重调解员的调解意见。
诉讼：
- 法律背景：如果协商和调解都无法解决争议，那么双方可以选择向人民法院提起诉讼。诉讼是解决争议最正式、最具有强制力的方式。
- 建议：在提起诉讼前，双方应充分准备证据材料，明确诉讼请求和事实理由。同时，可以选择聘请律师代理诉讼，以提高诉讼效率和胜诉率。在诉讼过程中，双方应遵守法庭纪律，尊重法官的裁决。
若合作协议中的仲裁条款存在瑕疵或不明确，导致无法直接仲裁，也可以尝试以下补救措施：
- 补充仲裁协议：如果双方愿意继续通过仲裁解决争议，可以协商签订补充仲裁协议，明确仲裁机构、仲裁规则等事项。
- 修改合作协议：如果合作协议中的仲裁条款存在严重瑕疵或不符合法律规定，双方可以协商修改合作协议，重新约定争议解决方式。
在处理合作协议争议时，还需要注意以下几点：
- 保留证据：无论选择哪种争议解决方式，双方都应保留好与争议有关的证据材料，如合作协议、交易记录、沟通记录等。
- 及时行动：一旦发现争议，双方应及时采取行动，避免拖延导致证据灭失或争议扩大。
- 尊重法律：在处理争议过程中，双方应尊重法律、尊重对方权益，避免采取过激行为或违法手段。
若您在处理合作协议争议过程中遇到任何法律问题或困惑，可以直接向我咨询。我会根据您的具体情况，提供专业的法律意见和解决方案。