结论前置：国企管理人员入股私营企业违法所得若主动上交但无法交全，可采取分期缴纳、申请减免或提供担保等方式处理，同时需积极配合调查并主动说明情况。以下是对此问题的详细分析：
一、法律背景与规定
国企管理人员入股私营企业，若涉及利益输送、违规操作等违法行为，其所得收益可能被认定为违法所得。根据《中华人民共和国刑法》及相关司法解释，违法所得应当予以追缴或责令退赔。对于主动上交违法所得的行为，法律通常给予一定的宽宥，但若无法一次性交全，则需根据具体情况采取相应措施。
二、处理方式
分期缴纳：
- 法律依据：虽然直接的法律条款可能并未明确提及分期缴纳，但在实际操作中，对于确实无法一次性交全违法所得的，执法机关或司法机关可能会根据具体情况，允许违法者分期缴纳。
- 操作建议：主动与执法机关或司法机关沟通，说明自身经济状况，提出分期缴纳的申请，并制定详细的缴纳计划。
申请减免：
- 法律依据：在特定情况下，如违法者经济状况极度困难，且违法所得并非其主要生活来源，可能可以申请减免部分或全部违法所得。但这种情况较为罕见，且需严格符合法定条件。
- 操作建议：准备充分的证据材料，证明自身经济状况确实困难，且违法所得并非其主要生活来源，向执法机关或司法机关提出减免申请。
提供担保：
- 法律依据：在无法一次性交全违法所得的情况下，违法者可以提供相应的担保，如房产、车辆等，以确保违法所得的最终追缴。
- 操作建议：与执法机关或司法机关协商，提供合适的担保物，并签订担保协议，明确担保责任和期限。
三、法律建议
积极配合调查：
- 国企管理人员应积极配合执法机关或司法机关的调查工作，如实说明情况，提供相关证据材料。
主动说明经济状况：
- 在无法一次性交全违法所得的情况下，应主动向执法机关或司法机关说明自身经济状况，提出合理的解决方案。
寻求法律援助：
- 若对处理方式存在疑问或需要进一步的法律帮助，可以寻求专业律师的协助，以确保自身权益得到妥善保护。
四、可能后果
若国企管理人员未主动上交违法所得或未按照约定缴纳违法所得，可能面临更严厉的法律制裁，包括但不限于罚款、没收财产、刑事处罚等。因此，建议国企管理人员在面临此类问题时，应积极配合调查，主动上交违法所得，并寻求合理的解决方案。
最后，若您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。