单位因档案年龄认定错误耽误员工职位晋升，应承担的责任主要包括民事赔偿责任，并可能涉及行政责任，具体分析如下：
一、民事赔偿责任
过错责任原则：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，单位因过错侵害他人民事权益造成损害的，应当承担侵权责任。在此情况下，单位因档案年龄认定错误，导致员工错过职位晋升机会，若该错误与单位的管理、审核等过错行为有关，单位应承担相应的赔偿责任。
赔偿范围：
- 赔偿范围通常包括员工因错过晋升而遭受的直接经济损失，如晋升后的薪资差额、奖金、福利等。同时，若员工能证明因错过晋升而遭受了精神损害，如名誉受损、职业发展受阻等，也可要求单位进行相应的精神损害赔偿。但精神损害赔偿的认定和计算通常较为复杂，需根据具体情况和证据进行判断。
举证责任：
- 员工需承担举证责任，证明单位存在过错，且该过错与错过晋升之间存在因果关系。这通常需要员工提供相关证据，如档案记录、晋升通知、薪资证明等。
二、行政责任
单位管理责任：
- 单位作为员工档案的管理者，有义务确保档案的准确性和完整性。若因单位管理不善导致档案年龄认定错误，单位可能面临相关行政部门的处罚或责令改正等行政责任。
具体行政措施：
- 行政部门可能要求单位对档案进行更正，并可能对单位进行警告、罚款等行政处罚。同时，若单位的行为构成严重违法或犯罪，还可能面临更严厉的刑事处罚（但在此案例中，刑事处罚的可能性较小，除非单位存在故意伪造、篡改档案等严重违法行为）。
三、实际操作建议
与单位协商：
- 员工可首先尝试与单位进行协商，要求单位承认错误并承担相应的赔偿责任。协商过程中，员工可提供相关证据以支持自己的主张。
申请劳动仲裁或提起诉讼：
- 若协商无果，员工可向当地劳动仲裁机构申请劳动仲裁，要求单位承担赔偿责任。若对仲裁结果不满，员工还可向法院提起诉讼，通过法律途径维护自己的合法权益。
注意证据收集：
- 在整个过程中，员工应注意收集相关证据，如档案记录、晋升通知、薪资证明、与单位的沟通记录等。这些证据将有助于员工在协商、仲裁或诉讼中证明自己的主张。
总结来说，单位因档案年龄认定错误耽误员工职位晋升，应承担民事赔偿责任，并可能涉及行政责任。员工可通过与单位协商、申请劳动仲裁或提起诉讼等方式来维护自己的合法权益。在此过程中，员工应注意收集相关证据以支持自己的主张。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。