您好，关于项目经理收了保证金如何处理的问题，这主要取决于保证金的类型和具体情境。以下我将根据两种常见的保证金类型——建设工程质量保证金和工资保证金，为您详细解答。
一、建设工程质量保证金
定义与目的：
- 建设工程质量保证金是发包人与承包人在建设工程承包合同中约定，从应付的工程款中预留，用以保证承包人在缺陷责任期内对建设工程出现的缺陷进行维修的资金。
处理流程：
- 预留与返还：发包人应在招标文件中明确保证金预留、返还等内容，并与承包人在合同中约定具体事项，如预留比例、期限、返还方式等。
- 缺陷责任期：缺陷责任期一般为1年，最长不超过2年，从工程通过竣工验收之日起计。在此期间，如因承包人原因造成缺陷，承包人应负责维修并承担费用；如因他人原因造成缺陷，发包人负责组织维修，承包人不承担费用。
- 返还申请与核实：缺陷责任期满后，承包人向发包人申请返还保证金。发包人应在接到申请后14天内会同承包人核实，如无异议，应按约定返还保证金。
特殊情况：
- 如发包人逾期未返还保证金，应依法承担违约责任。
- 如发包人和承包人对保证金预留、返还等有争议，应按合同约定的争议解决程序处理。
二、工资保证金
定义与目的：
- 工资保证金是施工总承包单位在工程所在地的银行存储或申请开立银行保函，用于依法保护农民工工资权益，解决拖欠农民工工资问题。
处理流程：
- 存储与备案：施工总承包单位应在工程取得施工许可证（或开工报告批复）之日起20个工作日内，持相关证件在经办银行开立工资保证金专门账户存储工资保证金，并将协议书副本送属地人力资源社会保障行政部门备案。
- 存储比例与浮动：工资保证金按工程施工合同额（或年度合同额）的一定比例存储，原则上不低于1%，不超过3%。根据施工总承包单位的信用状况和历史记录，存储比例可适当浮动。
- 使用与返还：在符合规定的情况下，如施工总承包单位连续未发生工资拖欠，其新增工程可降低存储比例或免于存储。工资保证金账户内本金和利息归开立账户的施工总承包单位所有，除符合特定情形外，其他任何单位和个人不得动用。
特殊情况：
- 如施工总承包单位发生工资拖欠，工资保证金存储比例应适当提高。
- 施工总承包单位可选择以银行保函替代现金存储工资保证金，保函担保金额不得低于按规定比例计算应存储的工资保证金数额。
综合建议
- 明确保证金类型：首先，需要明确项目经理收取的保证金是建设工程质量保证金还是工资保证金，因为两者的处理流程和规定有所不同。
- 遵循合同约定：无论是哪种类型的保证金，都应严格按照合同约定的条款进行处理，包括预留、返还、使用等。
- 及时沟通与协商：如遇到保证金处理上的争议或问题，应及时与发包人、承包人或相关行政部门进行沟通与协商，寻求妥善解决方案。
- 遵守法律法规：在处理保证金时，应严格遵守国家相关法律法规和政策规定，确保合法合规。
希望以上解答能对您有所帮助。如有其他疑问或需要进一步的帮助，请随时告知。