未注册登记的拆迁项目部签订的协议，其有效性需根据具体情况进行判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
拆迁项目部的法律地位：
- 拆迁项目部通常是拆迁人（如政府或开发商）为实施拆迁工作而设立的临时机构，它本身并不具备独立的法人资格。因此，其签订协议的行为，在法律上通常被视为拆迁人的行为，由拆迁人承担相应的法律责任。
- 如果拆迁项目部未经合法注册登记，但其行为得到了拆迁人的明确授权或追认，那么其签订的协议在法律上可能是有效的。这是因为，拆迁人的授权或追认使得拆迁项目部的行为具备了合法性。
协议内容的合法性：
- 无论拆迁项目部是否注册登记，其签订的协议内容都必须符合法律法规的规定。如果协议内容违反了法律、行政法规的强制性规定，或者损害了国家、集体或第三人的利益，那么该协议将被视为无效。
- 例如，如果协议中约定的补偿标准明显低于当地政府规定的最低补偿标准，或者协议中存在欺诈、胁迫等情形，那么该协议可能因违法而无效。
相对方的知情权与善意：
- 如果与拆迁项目部签订协议的相对方（如被拆迁人）在签订协议时并不知道拆迁项目部未注册登记，且其基于善意与拆迁项目部签订了协议，那么该协议在相对方善意且无过错的情况下，可能仍然具有一定的法律效力。但这种情况下的法律效力可能受到一定限制，如相对方可能无法直接要求拆迁项目部承担法律责任，而需要向拆迁人主张权利。
- 如果相对方在签订协议时明知拆迁项目部未注册登记，或者存在其他恶意情形，那么该协议可能因相对方的恶意而无效或可撤销。
实际履行情况：
- 协议的效力还与其实际履行情况有关。如果协议签订后，双方已经按照协议约定履行了各自的义务，且没有出现争议或纠纷，那么该协议在事实上可能已经被视为有效。但这种情况下的有效性并不意味着协议在法律上完全无懈可击，如果后续出现纠纷或争议，仍然需要根据法律法规进行判断和处理。
法律建议：
- 对于被拆迁人而言，在与拆迁项目部签订协议前，应尽可能了解拆迁项目部的法律地位和授权情况，确保协议的合法性和有效性。
- 如果对拆迁项目部的合法性或协议内容存在疑问，建议咨询专业律师或相关政府部门，以获取更准确的法律意见和指导。
- 在签订协议时，应仔细阅读协议条款，确保自己的权益得到充分保障。如果发现协议内容存在违法或不合理之处，应及时提出异议并拒绝签订。
可能法律后果：
- 如果未注册登记的拆迁项目部签订的协议被认定为无效或可撤销，那么双方可能需要根据法律法规承担相应的法律责任。例如，拆迁人可能需要重新与被拆迁人签订合法有效的协议，并按照新的协议约定进行补偿和安置；被拆迁人则可能无法依据原协议主张权利，而需要依据新的协议或法律法规来维护自己的权益。
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