小区业主第二辆车按外来车辆收费是否合法，需根据具体情况判断，主要取决于小区停车收费规定是否经过合法程序制定、收费标准是否合理以及停车位权属等因素。以下从不同角度进行分析：
合法情形
经过合法程序制定收费规定：
- 如果小区的停车收费规定，包括对外来车辆和业主第二辆车的收费标准，是经过业主大会或业主委员会通过合法表决程序决定的，并且符合当地物价部门的规定，那么这种收费行为是合法的。例如，参会业主三分之二以上参与表决，且经参与表决专有部分面积过半数的业主及参与表决人数过半数的业主同意，方可实施收费。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》，涉及共有和共同管理权利的重大事项应由业主共同决定。小区公共区域属于全体业主共有，因此停车收费等事宜需由业主大会或业委会来决定。
收费标准合理且透明：
- 收费标准应与当地市场行情相符，不能明显高于同类型小区的收费标准。同时，物业或管理方应提前告知并公示收费标准，确保收费的透明性。
- 实际案例：若小区内张贴了明确的停车收费标准，并且该标准经过了业主大会的同意，同时符合物价部门的规定，那么业主的第二辆车按此标准收费是合法的。
费用用途正当：
- 收取的停车费应主要用于小区停车设施的建设、维护、管理等与停车相关的合理开支，或补充小区专项维修资金。物业或管理方不得将停车费挪作他用。
- 法律依据：公共收益应专款专用，接受业主监督。物业应将费用用于规定的用途，并定期公布收支情况。
违法情形
未经业主同意擅自收费：
- 如果物业或管理方未经业主大会或业主委员会的同意，擅自决定对业主的第二辆车按外来车辆收费，则构成违法。因为小区的公共区域属于全体业主共有，物业无权擅自决定收费。
- 实际风险：业主有权拒绝支付此类未经同意的收费，并可以向相关部门投诉或寻求法律帮助。
收费标准过高或不合理：
- 若收费标准明显高于当地物价部门规定的指导标准或限价，或者超出了同类型小区的合理水平，则属于违法行为。过高的收费标准侵害了业主的合法权益。
- 法律依据：物价部门会根据经济水平、市场情况等因素制定指导标准或限价。小区收取的停车费应在这些规定的合理范围内。
费用挪用：
- 如收取的停车费被物业私自挪用，未用于小区公共事务，则构成违法。公共收益应专款专用，接受业主监督。
- 实际后果：业主有权要求物业公开收支情况，并可以对挪用费用的行为进行投诉或寻求法律救济。
建议与总结
- 对于业主：如果对小区的停车收费行为有疑问或不满，建议首先查看小区的停车收费规定是否经过了合法程序制定、收费标准是否合理以及费用用途是否正当。如有疑问，可以向物业或业主委员会咨询，并要求其提供相关的合法依据和公示信息。如果认为收费行为违法或不合理，可以向相关部门投诉或寻求法律帮助。
- 对于物业或管理方：应确保停车收费行为的合法性和合理性，提前告知并公示收费标准，明确费用用途，并接受业主的监督。在制定收费规定时，应充分征求业主的意见和建议，确保规定符合大多数业主的利益和需求。
综上所述，小区业主第二辆车按外来车辆收费是否合法，需根据具体情况判断。只有在满足所有合法条件的前提下，收费行为才具有合法性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。