当案件判决书中有两个被告时，申请强制执行确实需要遵循一套严谨且全面的流程，以确保对每个被告都执行相应的法律程序。以下是我为您详细梳理的申请强制执行指南：
一、明确执行依据与准备材料
首先，您需要持有已生效的判决书，这是申请强制执行的基础。判决书上会明确两个被告各自应履行的义务，这是后续执行的关键依据。
接下来，准备申请强制执行所需的材料：
- 强制执行申请书：在这份申请书中，您需要详细说明申请执行的事项、理由，以及两个被告未履行判决的具体情况。
- 主体资格证明材料：作为申请人，您需要提供自己的身份证明。同时，也需要提供两个被告的身份信息，如果被告是企业，则需提供营业执照副本及法定代表人身份证明。
- 生效法律文书副本：您需要提供判决书的原件或经法院盖章确认的副本，以及生效证明（如果适用）。
二、向法院提交申请
准备好上述材料后，您需要将这些材料提交给一审法院，或者与一审法院同级的被执行财产所在地法院。法院会对您的申请材料进行形式审查，确保材料齐全、格式正确。
三、法院受理与执行措施
- 受理立案：如果您的申请符合受理条件，法院会立案，并向您送达受理通知书。同时，法院也会向两个被告发出执行通知书，要求他们履行判决义务。
- 查询财产：法院会通过网络执行查控系统等方式，查询两个被告名下的各类财产状况，包括银行账户、房产、车辆等。
- 执行措施：
- 如果被告有金钱给付义务，法院可能会直接扣划其银行账户存款，或者查封、拍卖其资产以清偿债务。如果被告拒绝履行，还可能面临罚款、拘留等强制措施，甚至刑事责任。
- 如果判决要求被告完成特定行为，法院可能会委托他人完成该行为，并要求被告承担相关费用。如果被告不履行，同样可能面临罚款、拘留等措施。
四、执行方式的选择
在执行过程中，法院可能会根据具体情况选择不同的执行方式：
- 同时式执行：对两个被告同时发出执行通知书，可以采取全额执行或按份合并执行法。
- 选择式执行：在查明各被告的履行能力后，法院可能会选择易于执行的被告先进行执行。
- 转换式执行：根据案情的灵活变化，法院可能会适时转换执行方式。
五、分配执行财产
在执行过程中，如果获得了执行财产，法院会根据以下原则进行分配：
- 如果执行财产足以清偿全部债务，法院会按照判决书确定的份额进行分配。
- 如果执行财产不足以清偿全部债务，法院会根据相关法律规定按比例分配，并优先清偿享有优先权、担保物权的债权。
六、注意事项与异议提出
在申请强制执行的过程中，您需要注意以下几点：
- 确保全面执行：您需要确保对每个被告都进行了相应的执行程序，避免遗漏。
- 提出异议：如果您或利害关系人认为执行行为违反了法律规定，可以向负责执行的法院提出书面异议。法院会依法进行裁定，并保障您的合法权益。
综上所述，申请强制执行时需要准备充分材料，确保法院对每个被告都采取适当的执行措施，并根据执行情况合理分配财产。同时，您也需要关注执行过程中的各项规定与程序，以确保自身权益得到有效保障。希望这份指南能对您有所帮助。