对于职务犯罪数额巨大且在立案前投案退款的情形，处理方式需结合具体情节，但总体原则是依法从轻或减轻处罚，具体分析如下：

1. 自首情节的认定与量刑影响
   根据《刑法》第六十七条，犯罪嫌疑人自动投案并如实供述罪行的，构成自首，可依法从轻或减轻处罚；其中犯罪较轻的，可免除处罚。若在立案前主动投案并全额退还赃款，司法机关会重点审查其投案的主动性、供述的完整性及退款的真实性。若符合自首构成要件，量刑时将显著优于未自首情形，甚至可能突破法定刑幅度下限。

2. 退款行为的法律性质与量刑考量
   退款行为属于犯罪后的悔罪表现，根据《最高人民法院、最高人民检察院关于办理职务犯罪案件认定自首、立功等量刑情节若干问题的意见》，犯罪嫌疑人案发后退缴赃款赃物，可酌情从宽处罚。若在立案前完成退款，且无其他严重情节，司法机关可能将其认定为“积极退赃”，进一步强化从宽处罚的依据。但需注意，退款仅影响量刑，不改变犯罪性质，仍需承担刑事责任。

3. 数额巨大的具体认定与量刑基准
   职务犯罪中“数额巨大”的标准因罪名而异（如贪污罪、受贿罪等），通常指300万元以上。根据《刑法》第三百八十三条，数额巨大的贪污、受贿罪，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金或没收财产。若存在自首、退款等情节，可在该幅度内从轻或减轻处罚，例如降至三年以下有期徒刑或缓刑，但需结合具体案情（如犯罪手段、社会影响等）综合判断。

4. 程序上的处理流程
   立案前投案退款后，司法机关将按以下流程处理：

   • 立案审查：检察机关或公安机关审查投案材料，确认是否符合立案条件；
     
   • 强制措施：根据犯罪情节，可能采取取保候审、监视居住等非羁押措施；
     
   • 侦查与起诉：全面调查犯罪事实，若证据充分，将移送审查起诉；
     
   • 审判阶段：法院结合自首、退款等情节，依法作出判决，可能适用缓刑或减轻处罚。

建议：若涉及此类情形，应立即委托律师介入，协助准备自首材料、固定退款证据，并在侦查阶段争取取保候审，审判阶段争取缓刑或减轻处罚。具体策略需根据罪名、数额、情节等细化，可直接向我咨询详细方案。