交通工伤中，第三方赔偿之后公司并不能因此不认定工伤和不赔偿。以下从不同角度为你详细分析：

法律层面

1. 工伤认定与第三方赔偿的独立性
   • 根据《工伤保险条例》等相关法律法规，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病进行治疗，享受工伤医疗待遇。工伤认定是基于职工与用人单位之间的劳动关系以及职工受伤是否因工作原因等事实来确定的，与是否存在第三方赔偿并无直接关联。也就是说，只要符合工伤认定的条件，用人单位就应当依法为职工申请工伤认定。
   • 例如，小李在上班途中被一辆闯红灯的汽车撞伤，交警认定汽车司机负全责。小李既可以向汽车司机及其保险公司要求交通事故赔偿，同时，由于小李是在上班途中受到非本人主要责任的交通事故伤害，符合工伤认定的情形，用人单位也应当为其申请工伤认定。
2. 双重赔偿的可能性
   • 在一些情况下，职工可以同时获得工伤保险赔偿和第三方侵权赔偿。工伤保险赔偿是基于职工与用人单位之间的劳动关系，由工伤保险基金和用人单位按照规定支付相关待遇，如医疗费、伤残津贴等；而第三方侵权赔偿是基于侵权法律关系，由侵权方承担赔偿责任，如赔偿医疗费、误工费、护理费等。
   • 不过，对于医疗费等实际发生的费用，一般遵循“填平原则”，即不能重复获赔。但对于一些具有人身专属性的赔偿项目，如伤残赔偿金、死亡赔偿金等，在部分地区和情况下是可以同时获得的。例如，小张在工作中因第三方的过错导致伤残，除了可以从工伤保险基金获得伤残补助金等赔偿外，还可以向第三方要求伤残赔偿金等赔偿。

公司责任层面

1. 认定工伤的义务
   • 用人单位有义务在职工发生事故伤害或者按照职业病防治法规定被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。如果用人单位未按规定提出工伤认定申请的，工伤职工或者其近亲属、工会组织在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内，可以直接向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
   • 例如，小王在工作中受伤，公司认为已经有第三方赔偿了，就不为其申请工伤认定。这种做法是错误的，公司仍然需要按照规定为小王申请工伤认定，否则可能会承担相应的法律责任。
2. 工伤赔偿的责任
   • 如果职工被认定为工伤，用人单位需要按照《工伤保险条例》的规定，承担相应的工伤赔偿责任，如支付停工留薪期工资、护理费等。即使职工已经获得了第三方的赔偿，用人单位也不能免除这些法定的赔偿责任。
   • 例如，小赵在工作中受伤，被认定为工伤，虽然第三方已经赔偿了部分医疗费，但公司仍然需要按照规定支付小赵停工留薪期的工资，保障小赵在治疗期间的基本生活。

特殊情况说明

如果职工是因为故意犯罪、醉酒或者吸毒、自残或者自杀等情形导致受伤的，不得认定为工伤或者视同工伤，这种情况下公司自然无需承担工伤认定和赔偿责任，但这与是否存在第三方赔偿并无关系。

总之，在交通工伤中，第三方赔偿不能成为公司不认定工伤和不赔偿的理由。如果公司存在这种不当行为，职工可以通过向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁等途径维护自己的合法权益。如果你还有其他关于交通工伤的法律问题，可以直接向我咨询。