企业因员工迟到扣钱是否违法，需根据具体情况判断。以下是对此问题的详细分析：
一、合法情形
规章制度明确且合理：
- 企业有权制定内部规章制度，包括考勤制度和相应的奖惩措施。若规章制度中明确规定迟到扣钱的条款，并且该规定经过民主程序（如职工代表大会讨论通过）并公示告知员工，则企业依据此制度扣钱是合法的。
- 扣款金额应合理，通常不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。例如，若员工当月工资为5000元，企业最多只能扣除1000元作为迟到罚款，且扣除后员工工资不得低于当地最低工资标准。
劳动合同或集体合同有约定：
- 若企业与员工在劳动合同或集体合同中明确约定了迟到扣款的条款，且该约定不违反法律法规的强制性规定，则企业按照约定扣钱也是合法的。
二、违法情形
规章制度未公示或未经民主程序：
- 若企业的规章制度未向员工公示，或者虽然公示但未经过民主程序制定，则员工有权主张该制度无效，企业据此扣钱将构成违法。
扣款金额不合理：
- 如前所述，扣款金额应合理，不得超过法定限额。若企业随意设定高额罚款，甚至以罚款代替正常薪酬支付，将侵犯员工的合法权益。例如，若企业规定迟到一次罚款500元，而员工当月工资仅为3000元，这样的罚款金额显然不合理。
无合法依据扣款：
- 若企业没有明确的规章制度或劳动合同约定作为扣款依据，仅凭管理者的个人意志或口头通知就进行扣款，将构成违法。
以罚代管：
- 企业不能仅依赖罚款来管理员工，而应通过培训、沟通等方式提升员工的纪律性和工作效率。若企业过度依赖罚款手段，可能被视为以罚代管，违反劳动法的基本原则。
三、劳动者权益保护建议
- 了解公司规章制度：员工应仔细阅读公司的规章制度，了解关于迟到扣款的具体规定。
- 保留证据：如认为扣款不合理，员工应保留好相关证据（如考勤记录、工资条等），以便维权。
- 协商解决：在发生争议时，员工可与用人单位进行协商沟通，寻求双方都能接受的解决方案。
- 法律途径：若协商无果，员工可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
法律依据：
- 《中华人民共和国劳动法》第五十条：工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
- 《工资支付暂行规定（1994年版）》第十六条：因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
综上所述，企业因员工迟到扣钱是否违法，关键在于企业是否有合法的规章制度以及扣除的金额是否合理。员工在面对此类问题时，应了解自己的权益，并采取合适的措施进行维权。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。