在机动车与非机动车发生交通事故，且机动车与非机动车分别承担主次责任的情况下，自行车修理费的赔偿比例通常按照责任比例来确定。以下是对此问题的详细分析：
一、责任比例划分原则
根据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关法规，交通事故中的责任比例划分主要遵循过错原则，即根据事故双方当事人的过错程度来确定各自应承担的责任比例。在机动车与非机动车的事故中，若机动车承担主要责任，非机动车（如自行车）承担次要责任，那么赔偿比例也会相应地按照这一原则来划分。
二、常见责任比例及赔偿计算
70%与30%的比例：
- 在多数司法实践中，若机动车一方承担主要责任，非机动车一方承担次要责任，通常会按照机动车方70%、非机动车方30%的比例来确定赔偿份额。
- 计算公式：自行车修理费赔偿金额 = 自行车修理费总额 × 30%（非机动车方责任比例）。
其他可能的比例：
- 虽然70%与30%的比例较为常见，但具体比例还可能因事故具体情况、双方过错程度等因素而有所调整。例如，若非机动车存在明显过错（如违规行驶），而机动车过错相对较小，部分情况下可能会判定非机动车方承担更高比例的责任（如40%），相应地，机动车方承担的责任比例会降低（如60%）。但这种情况相对较少，且最终比例需由交通管理部门或法院根据事故现场勘查、调查取证及案件具体事实来认定。
三、赔偿范围与顺序
- 赔偿范围：自行车修理费属于因事故导致的直接财产损失，应纳入赔偿范围。
- 赔偿顺序：首先由机动车方的交强险在财产损失赔偿限额内进行赔付（通常为2000元），超出部分再按照责任比例分担。若机动车方还购买了商业三者险，超出交强险赔偿限额的部分也可能由商业三者险在一定范围内进行赔付。
四、实践中的操作建议
- 及时报案与保留证据：事故发生后，双方应立即向交通事故处理机关报警，并向各自承保的保险公司报案。同时，妥善保存交通事故责任认定书、自行车修理费发票等相关证据，为日后赔偿事宜提供有力支持。
- 协商处理与诉讼解决：在冷静、理性的基础上，尝试与对方协商达成赔偿协议。若协商不成，可提交给交警部门处理或通过法院诉讼解决争议。在诉讼过程中，法院会根据事故现场勘查、调查取证及案件具体事实来认定责任比例，并据此判决赔偿金额。
总结来说，在机动车与非机动车发生交通事故且双方分别承担主次责任的情况下，自行车修理费的赔偿比例通常按照责任比例来确定，常见比例为机动车方70%、非机动车方30%。但具体比例还需根据事故具体情况、双方过错程度等因素来综合考量。若您在此类事故中遇到法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。