结论前置：针对您提出的“工伤鉴定停薪12个月但实际只休息3个月，能否主张索赔”的问题，这主要取决于您是否因工伤导致实际收入减少，以及这种减少是否与工伤有直接关系。若确实存在收入减少且与工伤相关，您有权主张相应的赔偿。以下从不同角度为您详细分析：
一、工伤停工留薪期的确定与工资待遇
根据《工伤保险条例》第三十三条的规定，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。停工留薪期一般不超过12个月，伤情严重或者情况特殊，经设区的市级劳动能力鉴定委员会确认，可以适当延长，但延长不得超过12个月。
关键点：
- 停工留薪期是法律规定的，用于保障工伤职工在接受治疗期间的基本生活需要。
- 在停工留薪期内，职工应享受原工资福利待遇不变。
二、实际休息时间与停工留薪期不符的情况
若您工伤鉴定后确定的停工留薪期为12个月，但实际只休息了3个月便恢复工作，这并不意味着您不能主张停工留薪期的工资待遇。关键在于您是否因工伤导致实际收入减少，以及这种减少是否与工伤有直接关系。
可能的情况：
- 提前恢复工作但收入未受影响：如果您提前恢复工作，且工资收入未因工伤而减少，那么您可能无法主张额外的赔偿，因为您已经享受了原工资福利待遇。
- 提前恢复工作但收入减少：如果您提前恢复工作，但因工伤导致的工作能力下降或工作条件变化（如需要从事轻体力劳动等），导致实际收入减少，那么您有权主张因工伤导致的收入减少部分的赔偿。
- 未恢复工作但单位未支付停工留薪期工资：如果您因工伤无法继续工作，但单位未按照法律规定支付停工留薪期的工资，您有权要求单位支付该期间的工资待遇。
三、主张索赔的途径与证据收集
若您认为因工伤导致实际收入减少，且这种减少与工伤有直接关系，您可以通过以下途径主张索赔：
- 与单位协商：首先尝试与单位进行协商，要求单位支付因工伤导致的收入减少部分的赔偿。
- 申请劳动仲裁：如果协商无果，您可以向当地劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，要求单位支付相应的赔偿。
- 提起诉讼：如果对劳动仲裁结果不满意，您还可以向人民法院提起诉讼，通过法律途径维护自己的合法权益。
证据收集：
- 工伤认定决定书、劳动能力鉴定结论书等证明工伤事实和伤残等级的证据。
- 工资单、银行流水等证明原工资福利待遇的证据。
- 医疗证明、诊断证明等证明因工伤导致无法继续工作或工作能力下降的证据。
- 其他能够证明因工伤导致收入减少的证据。
四、注意事项
- 在主张索赔时，请确保您的诉求合理合法，不要提出过高的赔偿要求。
- 注意保留好相关证据，以便在协商、仲裁或诉讼过程中证明自己的主张。
- 如果对法律程序不熟悉，建议咨询专业律师（即我本人，喻燕立律师，专注于建设工程、劳动纠纷领域），以获得更专业的法律帮助。
最后，若您有任何关于工伤鉴定和赔偿的疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。