结论：针对您提出的“工伤劳动能力鉴定只给休三个月，但实际医院建议休六个月”的情况，您有权根据医院的建议进行休息，并应积极与用人单位及劳动能力鉴定委员会沟通，必要时可申请重新鉴定或采取其他法律措施来维护自己的权益。

详细分析：

1. 劳动能力鉴定与休息期的关系：

   • 劳动能力鉴定是确定工伤职工伤残等级和劳动能力丧失程度的重要依据，它对于确定工伤职工的休息期、治疗期以及后续的赔偿等都有着至关重要的作用。
   • 然而，劳动能力鉴定给出的休息期并不一定完全符合医院根据职工实际病情给出的建议。这是因为劳动能力鉴定更多考虑的是职工的整体劳动能力和伤残等级，而医院则更侧重于职工的具体病情和治疗需要。

2. 医院建议的效力：

   • 医院作为专业的医疗机构，其给出的休息建议是基于对职工病情的全面评估和治疗需要。因此，医院的建议具有较高的专业性和权威性。
   • 在实际操作中，如果医院给出的休息期长于劳动能力鉴定给出的休息期，职工通常应遵循医院的建议进行休息，以确保身体的充分恢复。

3. 与用人单位及劳动能力鉴定委员会的沟通：

   • 面对这种情况，您首先应与用人单位进行沟通，说明医院给出的休息建议，并请求用人单位根据医院的建议调整您的休息期。
   • 如果用人单位不同意调整，您可以向劳动能力鉴定委员会提出申请，要求重新进行劳动能力鉴定或就休息期进行专项鉴定。在申请时，您应提供医院的诊断证明、治疗记录等相关证据材料。

4. 法律措施：

   • 如果经过沟通协商和重新鉴定后，问题仍未得到解决，您可以考虑采取法律措施来维护自己的权益。例如，您可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求用人单位按照医院的建议给予您足够的休息期，并支付相应的工伤待遇。
   • 在仲裁或诉讼过程中，您应充分准备证据材料，包括医院的诊断证明、治疗记录、劳动能力鉴定报告等，以证明您的主张。

建议与提醒：

• 在处理此类问题时，建议您保持冷静和理性，避免与用人单位发生不必要的冲突和矛盾。
• 同时，您也应积极了解和学习相关的法律法规和政策规定，以便更好地维护自己的权益。
• 如果您在处理过程中遇到任何困难或疑问，可以随时向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议和帮助。