结论：针对您描述的情况，虽然欠条上有您父亲的签字，但款项并未实际打入您父亲的账户，这可能会影响借款事实的认定。不过，具体还需结合其他证据和案件细节来判断。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
一、借款事实的认定
欠条的法律效力：欠条作为书面证据，通常能够证明双方之间存在借贷的合意。然而，欠条本身并不足以证明借款已经实际交付。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，借款合同是借款人向贷款人借款，到期返还借款并支付利息的合同。因此，除了欠条外，还需要有借款实际交付的证据。
借款交付的证据：在民间借贷纠纷中，借款交付的证据至关重要。这通常包括银行转账记录、收条、证人证言等。如果款项并未打入您父亲的账户，那么您需要寻找其他证据来证明借款已经实际交付，比如对方是否以其他方式（如现金、第三方支付等）将款项交付给您父亲，或者是否有其他相关证据能够佐证借款事实。
二、可能的法律后果
如果借款未实际交付：如果法院认定借款并未实际交付给您父亲，那么欠条可能无法作为有效的债权凭证。在这种情况下，对方可能无法依据欠条要求您父亲偿还借款。然而，如果对方能够提供其他证据证明借款已经实际交付，那么您父亲仍然可能需要承担还款责任。
如果借款已实际交付但方式特殊：如果借款确实已经实际交付，但交付方式并非通过银行转账，而是通过其他方式（如现金、第三方支付等），那么您需要提供相应的证据来证明这一点。例如，如果借款是通过现金交付的，您可以尝试寻找在场证人或提供其他相关证据来佐证借款事实。
三、应对策略
收集证据：针对对方起诉的情况，您父亲应积极收集与借款相关的证据，包括但不限于欠条、银行转账记录（如果有的话）、收条、证人证言等。这些证据将有助于证明借款事实的真实性和合法性。
咨询专业律师：由于民间借贷纠纷涉及复杂的法律问题和证据规则，建议您父亲咨询专业律师以获取更具体的法律建议。律师可以根据案件的具体情况，为您父亲制定合适的应对策略，并代表其参与诉讼活动。
准备应诉材料：在收到法院的传票后，您父亲应按照法院的要求准备应诉材料，包括答辩状、证据清单等。在答辩状中，您可以针对对方的诉讼请求进行反驳，并阐述自己的观点和理由。
最后，针对您父亲被起诉的情况，建议您父亲保持冷静，积极应对，并尽快咨询专业律师以获取更具体的法律建议。如果您有任何进一步的法律问题或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。