在不起诉案件中，是否应该发检察建议，需根据具体情况和法律规定来判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
检察建议的适用范围与目的
- 检察建议是人民检察院依法履行法律监督职责，参与社会治理，维护司法公正，促进依法行政，预防和减少违法犯罪，保护国家利益和社会公共利益，维护个人和组织合法权益，保障法律统一正确实施的重要方式。它通常用于建议有关单位完善制度、加强内部监督制约、正确实施法律法规等。
- 在不起诉案件中，如果检察院认为有必要对涉案单位或个人的行为进行监督、纠正或预防类似行为再次发生，且该行为不构成犯罪或虽构成犯罪但情节轻微，依法可以不起诉的，检察院可以发出检察建议。
不起诉案件的类型与检察建议的关联性
- 法定不起诉：对于犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或者符合《刑事诉讼法》第十六条规定的情形之一的（如情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；犯罪已过追诉时效期限的；经特赦令免除刑罚的等），人民检察院应当作出不起诉决定。在此类案件中，由于犯罪嫌疑人本身不构成犯罪，检察院通常不会发出检察建议，除非发现涉案单位或个人存在其他需要监督或纠正的问题。
- 酌定不起诉：对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。在此类案件中，如果检察院认为涉案单位或个人在管理、制度等方面存在漏洞或问题，且这些问题与案件的发生有关联，检察院可以发出检察建议，以促进其改进和完善。
- 存疑不起诉：对于经过二次补充侦查，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，可以作出不起诉决定。在此类案件中，由于证据不足，无法确定犯罪嫌疑人的罪行，检察院通常不会直接发出检察建议，但可能会根据案件情况，对侦查机关的侦查活动提出意见或建议。
检察建议的发出程序与要求
- 检察院在发出检察建议前，应当进行充分的调查核实，确保建议的针对性和可行性。
- 检察建议应当明确、具体，指出存在的问题、提出改进的建议或措施，并要求被建议单位或个人在规定期限内回复处理情况。
- 检察院应当对检察建议的落实情况进行跟踪监督，确保建议得到有效执行。
建议：在不起诉案件中，是否发出检察建议需根据案件具体情况、涉案单位或个人的行为性质以及检察院的法律监督职责来综合判断。如果认为有必要发出检察建议以促进涉案单位或个人改进和完善，检察院应当依法、审慎地发出检察建议，并跟踪监督其落实情况。如有具体案件或法律问题，可直接向我咨询。