单位丢失职工档案，通常应由用人单位承担相应责任。这一结论是基于我国现行的法律法规以及司法实践所得出的。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据明确单位责任
《中华人民共和国档案法》的相关规定：
- 根据《档案法》第七条，机关、团体、企业事业单位和其他组织有妥善保管本单位档案的法定义务。职工档案作为单位管理的一部分，单位同样负有保管责任。若因单位原因导致职工档案丢失，显然违反了这一法定义务。
- 《档案法》第四十八条进一步规定了单位或个人丢失属于国家所有的档案应承担的法律责任。虽然该条款主要针对国家所有档案，但个人档案作为单位管理的重要组成部分，其丢失也反映了单位的管理不善，可能对员工权益造成侵害。在司法实践中，单位丢失职工档案往往也会被视为违反了《档案法》的精神和原则，从而承担相应的法律责任。
《企业职工档案管理工作规定》的具体要求：
- 《企业职工档案管理工作规定》第十八条和第十九条明确了单位在职工档案转递过程中的具体要求和责任。单位必须按规定时间、程序和要求转递职工档案，并确保档案的安全。若单位未按规定操作导致档案丢失，需承担相应的责任。
- 该规定第二十四条还指出，违反档案管理规定，造成档案损失的，应根据损失情况赔偿经济损失，并对直接责任者给予行政处分。
二、司法解释与司法实践支持单位担责
最高人民法院的司法解释：
- 最高人民法院在相关司法解释中明确，保存档案的企事业单位违反关于妥善保存档案的法律规定，丢失他人档案的，应当承担相应的民事责任。这意味着，如果单位丢失了职工的档案，职工有权起诉要求单位补办档案并赔偿因此造成的经济损失。
司法实践中的案例：
- 在司法实践中，法院通常会根据具体情况判决丢失职工档案的单位承担补办档案、赔偿经济损失等责任。例如，因档案丢失导致职工无法正常办理退休手续而遭受的退休金损失，单位应予以赔偿。
三、单位担责的具体情形与例外
单位担责的情形：
- 保管不善：若因单位管理不善（如档案保管场所不符合要求、发生火灾水灾等）或档案管理人员疏忽大意导致档案遗失，单位应承担民事赔偿责任，赔偿职工因此遭受的实际损失（如养老金损失、工资差额等）。同时，单位还有义务协助职工补办档案，出具相关证明材料。
- 违法操作：若单位存在故意隐匿、销毁职工档案等违法行为，不仅需承担民事赔偿责任，还可能面临行政处罚。根据《档案法》规定，损毁、丢失属于国家所有的档案的，相关部门将对直接负责的主管人员或其他直接责任人员依法给予处分。
单位不担责的例外情形：
- 不可抗力因素：如地震、海啸等自然灾害导致的档案缺失，超出单位控制范围。在单位已尽合理预防和保护措施的情况下，单位可能不需承担全部责任，但仍应协助职工尽量恢复档案相关信息。
- 职工自身原因：如职工本人擅自借出档案后丢失，或在档案交接过程中未妥善保管导致档案缺失，单位通常不承担责任。但单位可根据实际情况，在力所能及的范围内协助职工解决问题。
四、职工应对措施与建议
- 及时告知单位：职工发现档案缺失后，应立即告知单位，并要求单位协助查找或补办档案。
- 保留证据：职工应保留与档案缺失相关的所有证据，如与单位的沟通记录、档案交接单等，以便在后续维权过程中使用。
- 寻求法律救济：如果单位拒绝承担责任或无法补办档案，职工可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼，要求单位承担相应的法律责任。
综上所述，单位丢失职工档案是一种严重的违法行为，用人单位应当依法承担相应的责任。这不仅是对法律法规的遵守，也是对职工合法权益的保障。在实际操作中，单位应加强档案管理，完善档案保管制度，确保职工档案的安全和完整。同时，职工也应了解自己的档案权益，一旦发现档案丢失或损毁，应及时向单位主张权利并寻求法律救济。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。