计件工迟到被扣工资是否合法，需根据具体情况判断，以下分情况说明：
有合法有效的规章制度且扣款合理
- 规章制度合法有效：用人单位（包括实行计件工资制的单位）应通过民主程序（如职工代表大会或全体职工大会）制定包含迟到扣工资相关内容的规章制度，并确保内容合法合理。规章制度中关于迟到扣工资的规定应具体明确，如每月迟到累计次数、每次扣除的工资比例等，且这些规定不能明显超出合理范围。同时，用人单位需将规章制度向员工进行公示或告知，确保员工清楚知晓迟到会被扣除工资及具体的扣除标准。
- 扣款额度合理：扣罚的金额不能过高，不能使得员工的工资低于当地最低工资标准。根据《工资支付暂行规定》，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可从劳动者工资中扣除赔偿，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。对于计件工而言，同样应遵循这一原则，即扣款后工资不得低于最低工资标准。
- 符合劳动合同约定：如果在劳动合同中明确约定了迟到扣工资的相关条款，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位按照合同约定对迟到员工扣工资是合法的。
缺乏制度依据或扣款不合理
- 缺乏制度依据：若用人单位没有制定相关的规章制度，或者规章制度的制定没有经过民主程序，直接对迟到员工扣工资就缺乏合法依据。例如，领导随意口头决定扣工资，无任何书面制度依据，这种行为是不合法的。
- 扣款额度不合理：若扣罚的金额过高，明显超出了合理范围，甚至导致员工的工资低于当地最低工资标准，这种扣工资行为是不合法的。对于计件工而言，如果因为一次迟到就扣除大量工资，导致当月工资低于最低工资标准，那么这种扣款行为就是违法的。
法律建议：
- 对于用人单位：应依法制定规章制度，并合理行使用工自主权。在制定规章制度时，应确保内容合法合理，且经过民主程序制定并公示或告知员工。同时，在扣款时应确保扣款额度合理，不得低于当地最低工资标准。
- 对于劳动者：应了解自己的权益，并采取合法途径维护自己的利益。如果认为用人单位的扣款行为不合法或不合理，可以首先尝试与用人单位进行沟通协商，要求其按照法律规定和合同约定支付工资。若协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，甚至提起诉讼来维护自己的合法权益。
法律依据：
- 《中华人民共和国劳动合同法》第四条：用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。在规章制度和重大事项决定实施过程中，工会或者职工认为不适当的，有权向用人单位提出，通过协商予以修改完善。用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。
- 《工资支付暂行规定》第十六条：因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
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