在侵占集体资产被查的情况下，一般是先要求退赃，但这并不妨碍同时进行公诉程序，两者并非严格的先后顺序关系，而是可以并行推进。以下从不同角度为你详细分析：

从法律程序角度

1. 退赃要求：当侵占集体资产的行为被发现后，相关部门（如公安机关、监察机关等）在调查过程中，通常会要求涉案人员退还非法侵占的资产。这是因为退赃是衡量犯罪嫌疑人社会危害性、悔罪态度的一个重要因素。及时退赃可以在一定程度上减轻犯罪嫌疑人的法律责任，例如在量刑时可能会作为从轻或减轻处罚的情节予以考虑。
2. 公诉程序：公诉程序是检察机关代表国家对犯罪嫌疑人提起诉讼，追究其刑事责任的过程。一旦公安机关或监察机关完成调查，认为犯罪事实清楚，证据确实、充分，就会将案件移送检察机关审查起诉。检察机关审查后，如果认为符合起诉条件，就会向法院提起公诉。公诉程序的启动并不依赖于退赃的完成，即使犯罪嫌疑人尚未退赃，检察机关也可以依法提起公诉。

从实际操作角度

1. 并行推进：在实际操作中，退赃和公诉程序往往是并行推进的。相关部门在要求犯罪嫌疑人退赃的同时，也会继续进行调查取证工作，为公诉程序做准备。犯罪嫌疑人退赃的表现会被记录在案，并在后续的法律程序中作为量刑的参考因素。
2. 退赃对公诉的影响：虽然退赃并不影响公诉程序的启动，但犯罪嫌疑人积极退赃的态度可能会对其最终的刑事责任产生积极影响。例如，法院在量刑时可能会考虑犯罪嫌疑人的退赃情况，决定是否从轻或减轻处罚。

特殊情况说明

如果犯罪嫌疑人拒不退赃，这将被视为其悔罪态度恶劣，可能会在量刑时被从重处罚。同时，拒不退赃也不会阻止公诉程序的进行，检察机关仍然会依法提起公诉，追究犯罪嫌疑人的刑事责任。

给你的建议：

• 如果你或你身边的人涉嫌侵占集体资产，建议尽快咨询专业律师，了解自己的法律权利和义务。
• 在案件调查过程中，积极配合相关部门的工作，如实陈述事实，提供证据。
• 如果确实存在侵占行为，建议尽快退赃，以减轻法律责任。

如果你有任何进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供专业的法律帮助。