在临时征地已签补偿协议但补偿款未到位的情况下，施工方一般不能进行施工。这一结论主要基于以下法律分析和理由：
一、法定程序与原则
先补偿后征地原则：
- 根据《中华人民共和国土地管理法》及相关法律法规，国家征收土地时，必须遵循“先补偿后征地”的原则。这意味着在施工之前，必须完成对被征地农民的补偿工作，确保他们的合法权益得到保障。
- 县级以上地方人民政府应组织相关部门测算并落实补偿费用，确保资金足额到位，并与拟征收土地的所有权人、使用权人就补偿、安置等事项签订协议。在补偿款未到位的情况下，施工方进行施工，明显违反了这一法定程序。
保护被征地人权益：
- 征地补偿是被征地人失去土地及相关权益后的合理经济补偿。如果被征地人在未获得应得补偿的情况下，施工方即开始施工，这将严重损害被征地人的合法权益。被征地人对其土地及地上附着物等拥有合法的财产权，他们有权在获得充分补偿前拒绝他人对其土地进行开发施工等行为。
二、法律风险与后果
易引发社会矛盾：
- 被征地农民若未获得应有的补偿，而土地却被施工建设，极易引发他们与施工方、政府之间的矛盾和冲突，影响社会稳定。
后续问题处理复杂：
- 若未支付补偿就施工，后续可能面临被征地农民通过法律途径维权的问题，如要求停止施工、支付补偿并赔偿损失等。这将导致施工项目暂停，甚至可能使项目方承担额外的法律责任和经济成本。
违法施工的严重后果：
- 在未支付补偿款的情况下进行施工，违反了《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，属于违法行为。被征地农民有权要求停止施工，并采取法律措施维护自身权益。
- 政府或相关部门也有权责令违法施工方改正，并可能对其处以相应的行政处罚，如罚款、责令恢复原状等。
三、特殊情况的处理
- 在特殊情况下，如因公共利益需要紧急用地且经过法定审批程序，可能存在不同的处理方式。但这也必须严格依法进行，并确保被征地农民的合法权益得到妥善保护。例如，可能需要通过特别的法律程序来平衡公共利益与个人权益之间的关系，且后续仍需按照规定办理相关手续和落实补偿事宜。然而，这种情况有着严格的条件限制和审批程序，与一般的征地施工情况截然不同。
四、建议与指导
- 确保补偿到位后再施工：在临时征地过程中，施工方应确保补偿款已经足额支付给被征地农民，或者至少已经与被征地农民签订了补偿协议并明确了补偿款的支付时间和方式。只有在补偿问题得到妥善解决后，施工方才能进行施工活动。
- 积极沟通协商：如果因特殊原因导致补偿款暂时无法到位，施工方应与被征地农民进行积极沟通协商，说明情况并寻求解决方案。例如，可以协商签订补充协议，明确补偿款的支付时间和违约责任等。
- 寻求法律帮助：如果施工方与被征地农民在补偿问题上存在争议或纠纷，建议及时寻求专业法律帮助。作为专业律师，我可以提供具体的法律意见和帮助，协助双方通过合法途径解决争议和纠纷。
综上所述，从法律和安全的角度出发，在临时征地已签补偿协议但补偿款未到位的情况下，施工方一般不能进行施工。正确的做法是遵循法律法规，确保征地补偿到位后再进行后续的施工活动，以避免不必要的法律风险和实际问题。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。