没有直接证据时，仍然可以申请劳动仲裁确认劳动关系，但缺乏证据会极大增加案件处理的难度，甚至可能导致败诉。以下是对此问题的详细分析：

一、申请仲裁的权利基础

根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的规定，只要劳动者与用人单位之间存在劳动争议，并且该争议属于该法的适用范围，劳动者就有权向劳动争议仲裁委员会提出仲裁申请。这一权利并不因证据的缺失而被剥夺，仲裁机构应当受理此类申请。然而，没有证据支持的主张在实践中将面临极大的挑战。

二、证据的重要性及面临的困难

在确认劳动关系的仲裁中，证据是判断劳动关系是否存在的关键。仲裁机构主要依据双方提供的证据来查明事实。如果劳动者无法提供任何证据，而用人单位又否认存在劳动关系，那么劳动者将很难证明自己的主张，从而可能承担不利的仲裁结果。

三、无证据时的应对策略

1. 收集间接证据：

   • 尽管直接证据如劳动合同、工资支付记录等缺失，但劳动者可以尝试寻找其他间接证据，如同事证言、工作照片、视频、与公司往来的邮件或短信等。
   • 这些间接证据需能相互印证，形成完整的证据链，以证明劳动关系的存在。例如，多名同事的书面证言结合工作现场的照片、视频，以及与公司负责人的通话录音，可能构成完整的证据链。

2. 利用法律规定推定劳动关系：

   • 根据原劳动和社会保障部《关于确立劳动关系有关事项的通知》，若用人单位未与劳动者签订劳动合同，但具备以下情形，可认定劳动关系成立：
     • 用人单位和劳动者符合法律、法规规定的主体资格；
     • 劳动者受用人单位管理，从事有报酬的劳动；
     • 劳动者提供的劳动是用人单位业务的组成部分。

3. 申请调查取证：

   • 若关键证据由用人单位掌握，劳动者可向仲裁委员会申请调查取证。例如，要求单位提供工资发放记录、考勤数据等材料。

四、实际案例与启示

实践中存在劳动者在无直接证据的情况下，通过间接证据链成功确认劳动关系的案例。例如，有劳动者通过微信聊天记录中涉及工作内容、工作时间的信息，辅以证人证言，获得了仲裁委的认可。这表明，在缺乏直接证据时，通过合理收集和运用间接证据，仍然有可能成功确认劳动关系。

五、注意事项

1. 时效问题：劳动仲裁需在知道权利被侵害之日起一年内提出，逾期可能丧失胜诉权。
2. 诚信义务：提交的证据必须真实合法，伪造证据将承担法律责任。

建议：尽管在没有直接证据的情况下也可以申请确认劳动关系的仲裁，但为了提高胜诉率并维护自身权益，劳动者应尽可能多地收集并提交相关证据。如果确实缺乏证据，但仍然认为存在劳动关系，可以向我咨询，我会根据具体情况给出更具体的建议和指导，帮助你尽可能地准备和整理相关证据，制定合适的仲裁策略。