在劳动关系存续期间，确认劳动关系的争议确实受到仲裁时效的限制，劳动者应在知道或应当知道其权利被侵害之日起一年内提出仲裁申请，但特殊情况下存在时效中断、中止及不受限制的情形。以下是对这一问题的详细分析：

一、一般仲裁时效

根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。这一时效从劳动者知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。对于确认劳动关系的争议而言，这通常意味着从劳动者或用人单位意识到双方存在劳动关系争议的那一刻开始计算。例如，若用人单位否认与劳动者存在劳动关系，导致劳动者无法享受相应权益，劳动者应在此情况发生后的一年内向劳动争议仲裁委员会提出仲裁申请，以确认劳动关系。

二、仲裁时效的中断

仲裁时效可因以下情形而中断：

1. 劳动者向用人单位主张权利：如劳动者向用人单位书面要求确认劳动关系，这表明劳动者正在积极行使自己的权利，仲裁时效因此中断。
2. 向有关部门请求权利救济：如劳动者向劳动监察部门投诉反映用人单位不承认劳动关系的问题，这也是劳动者在寻求权利救济，仲裁时效同样会中断。
3. 用人单位同意履行义务：如用人单位承诺会解决劳动关系确认事宜，这表明用人单位愿意履行其义务，仲裁时效也会因此中断。

当中断情形发生时，仲裁时效期间将重新计算，即从中断时起再计算一年。

三、仲裁时效的中止

在特定情况下，仲裁时效可中止，如：

1. 不可抗力事件：如发生自然灾害、战争等不可抗力事件，导致劳动者无法在仲裁时效内申请仲裁，仲裁时效将中止。
2. 正当理由：如劳动者因突发重大疾病住院治疗等正当理由，导致无法在仲裁时效内申请仲裁，仲裁时效也会中止。

当中止时效的原因消除后，仲裁时效剩余的时间将继续计算。

四、特殊情况

1. 持续劳动关系：如果劳动关系一直持续，对于确认劳动关系的仲裁申请，一般不受仲裁时效的限制，因为劳动者的权利处于持续被侵害状态。但需注意，这并不意味着劳动者可以无限期地拖延申请仲裁，而是在劳动关系存续期间内，劳动者可以随时提出仲裁申请。
2. 拖欠劳动报酬：劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的，劳动者申请仲裁不受一年时效期间的限制。但劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出仲裁申请。不过，单纯确认劳动关系的争议并不属于拖欠劳动报酬争议范畴，因此仍适用一般的一年仲裁时效规定。

五、实际操作建议

1. 及时行使权利：劳动者应密切关注仲裁时效规定，确保在法定期限内提出仲裁申请，以避免因超过时效而丧失法律保护。
2. 收集证据：及时收集、保存相关证据材料，如劳动合同、工资单、工作证等，以便在仲裁过程中证明自己的主张。
3. 咨询专业律师：在处理劳动争议时，劳动者可以咨询专业律师，以获取更准确的法律信息和专业的法律建议。

综上所述，确认劳动关系的争议在劳动关系存续期间受到仲裁时效的限制，但存在多种特殊情形影响时效的计算。劳动者在处理相关事务时，应充分了解并遵循时效规定，以有效维护自身合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。