结论：关于已租代购还不起车款，把车退回租赁公司并签订车辆委托管理协议是否有效的问题，这主要取决于协议的具体内容以及签订时的双方真实意思表示，若协议内容合法且双方意思表示真实，则协议有效；反之，则可能无效或存在效力瑕疵。以下从多个角度进行分析：
一、协议有效的情形
协议内容合法：车辆委托管理协议的内容必须符合法律法规的规定，不得违反法律、行政法规的强制性规定，也不得违背公序良俗。例如，协议中不得约定非法占有、使用、处分车辆等条款。
双方意思表示真实：签订协议时，双方必须基于真实的意思表示，不存在欺诈、胁迫、乘人之危等情形。如果租赁公司利用你还不起车款的困境，迫使你签订不公平的协议，那么该协议可能因意思表示不真实而无效。
协议形式合法：虽然车辆委托管理协议不一定需要采用书面形式，但为了证明双方的权利义务关系，建议采用书面形式签订。如果协议以书面形式签订，且双方签字或盖章确认，那么协议的形式就是合法的。
二、协议可能无效或存在效力瑕疵的情形
协议内容违法：如果协议内容违反了法律法规的强制性规定，如约定非法转让车辆所有权、逃避税收等，那么该协议就是无效的。
存在欺诈、胁迫等情形：如果租赁公司在签订协议时存在欺诈、胁迫等行为，导致你签订了不公平的协议，那么你可以向法院或仲裁机构申请撤销该协议。
协议未实际履行或履行不能：如果协议签订后，由于各种原因（如车辆被查封、扣押等）导致协议无法实际履行，或者租赁公司未按照协议约定履行其义务，那么该协议可能因履行不能或未履行而存在效力瑕疵。
三、法律建议
仔细审查协议内容：在签订车辆委托管理协议前，务必仔细审查协议内容，确保协议内容合法、公平、合理。如果对协议内容有疑问或不确定的地方，建议咨询专业律师的意见。
保留相关证据：在签订协议过程中，务必保留好相关证据，如协议文本、签字或盖章的凭证、沟通记录等。这些证据在后续可能发生的纠纷中将起到至关重要的作用。
及时寻求法律帮助：如果你在签订或履行协议过程中遇到任何问题或纠纷，建议及时寻求法律帮助。作为专业律师，我可以为你提供全面的法律咨询和辩护服务，帮助你维护自己的合法权益。
最后，关于已租代购还不起车款并退回车辆后签订的车辆委托管理协议是否有效的问题，不能一概而论。它取决于协议的具体内容以及签订时的双方真实意思表示。如果你对此有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。