协议书上的笔记和指纹在符合一定条件下是可以鉴定出来的。以下从笔记鉴定和指纹鉴定两个角度进行详细分析：

笔记鉴定

1. 鉴定原理：笔记鉴定，也称为笔迹鉴定，是通过对书写人书写习惯特征的比对分析，来判断两份或多份笔迹是否为同一人所写。这主要依赖于书写人的独特书写风格、笔压、笔画顺序等特征。

2. 鉴定条件：

   • 样本充足：需要提供足够的、与检材（即需要鉴定的协议书上的笔记）书写时间相近、书写条件相似的样本笔迹，以便进行比对分析。
   • 质量良好：检材和样本笔迹的质量应良好，字迹清晰，无严重模糊、涂改或污染等情况，以确保鉴定结果的准确性。

3. 鉴定流程：通常包括受理鉴定、收集检材和样本、比对分析、出具鉴定意见等步骤。鉴定机构会运用专业的技术和设备，对笔迹进行细致的比对和分析，最终出具鉴定意见。

指纹鉴定

1. 鉴定原理：指纹鉴定是通过对指纹的纹线形态、结构特征的比对分析，来判断两枚指纹是否为同一人所留。指纹具有唯一性和稳定性，因此指纹鉴定在刑事侦查和民事诉讼中都有广泛应用。

2. 鉴定条件：

   • 指纹清晰：协议书上的指纹应清晰可辨，无严重模糊、重叠或污染等情况，以便提取和比对。
   • 保存完好：指纹的保存条件应良好，避免指纹因时间、环境等因素而发生变化或消失。

3. 鉴定流程：通常包括指纹提取、指纹比对、出具鉴定意见等步骤。鉴定机构会运用专业的技术和设备，对指纹进行提取和比对分析，最终出具鉴定意见。

综合分析

• 鉴定可行性：在协议书上的笔记和指纹都清晰、保存完好的情况下，且能够提供足够的样本进行比对分析，那么笔记和指纹都是可以鉴定出来的。
• 鉴定意义：笔记和指纹的鉴定结果在合同纠纷等民事诉讼中具有重要的证据价值。它们可以帮助法院或仲裁机构判断协议书的真实性、有效性以及当事人的真实意愿等。
• 注意事项：在进行笔记和指纹鉴定时，应选择具有合法资质和丰富经验的鉴定机构进行鉴定，以确保鉴定结果的准确性和可靠性。同时，鉴定过程应严格遵守相关法律法规和鉴定程序，确保鉴定的公正性和合法性。

如果您在合同纠纷中遇到需要鉴定协议书上的笔记或指纹的情况，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议和帮助。