在故意伤害罪案件中，若检察院作出存疑不起诉决定，被害人通常有权向人民法院提起自诉，以维护自身合法权益。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据与自诉权利
根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，特别是第二百一十条第三项，自诉案件包括“被害人有证据证明对被告人侵犯自己人身、财产权利的行为应当依法追究刑事责任，而公安机关或者人民检察院不予追究被告人刑事责任的案件”。这一条款明确赋予了被害人在检察院不起诉情况下的自诉权利。存疑不起诉，即检察院因证据不足或存在疑点，无法明确证明被告人有罪而作出的不起诉决定，并不妨碍被害人行使这一权利。
二、提起自诉的条件
被害人身份：必须是案件的直接被害人或其法定代理人、近亲属，他们才有权提起自诉。
证据要求：被害人需要准备充分的证据材料，如医疗记录、伤情鉴定报告、证人证言、监控视频等，以证明被告人实施了故意伤害行为，且该行为依法应当追究刑事责任。这些证据应能清晰地展示伤害行为的发生、伤害的程度以及被告人与伤害行为之间的因果关系。
程序前置：虽然法律允许被害人直接向法院提起自诉，但通常建议在被害人已经向公安机关报案，且公安机关或检察机关未予追究刑事责任的情况下进行。这有助于确保自诉的合法性和有效性。
三、提起自诉的程序与注意事项
准备材料：被害人需要准备起诉状及相关证据材料，确保材料的完整性和真实性。
提交法院：将准备好的材料提交给有管辖权的人民法院，并按照法院的要求进行后续操作。
法院审查：法院会对提交的材料进行审查，决定是否受理案件。如果法院认为证据不足或不符合自诉条件，可能会驳回起诉。
开庭审理：如果法院受理了案件，会安排开庭审理，听取双方当事人的陈述和辩论，并作出判决。
注意事项：
时效问题：被害人应在法律规定的追诉时效内提起自诉，以免因超过诉讼时效而丧失胜诉权。
证据充分性：被害人应尽可能收集充分的证据来支持自己的主张，以提高胜诉的可能性。如果证据不足或无法充分证明被告人有罪，可能会面临败诉的风险。
法律援助：如果被害人经济困难或法律知识有限，可以寻求法律援助机构的帮助，以更好地维护自己的合法权益。
四、特殊情况下的自诉限制
虽然被害人通常有权在检察院不起诉后提起自诉，但也存在一些特殊情况下的限制。例如，如果检察院的不起诉决定是基于“情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪”或“经特赦令免除刑罚”等原因作出的，被害人仍可依据相关法律规定向人民法院起诉。然而，若检察院认为犯罪嫌疑人没有犯罪事实或符合《刑事诉讼法》第十六条规定的情形之一（如犯罪已过追诉时效期限、犯罪嫌疑人死亡等）而作出不起诉决定，则被害人不能再提起自诉，但可依法申请复议或提请复核。
综上所述，在故意伤害罪案件中，若检察院作出存疑不起诉决定，被害人通常有权向人民法院提起自诉。但在实际操作中，需仔细考虑案件的具体情况、证据是否充分以及是否符合提起自诉的条件和法律规定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。