土地流转后种果树是否合法，需根据土地性质、流转合同约定以及当地法律法规等多方面因素综合判断。以下是对此问题的详细分析：

一、土地性质

1. 基本农田

   • 明确禁止：根据《基本农田保护条例》的严格规定，基本农田保护区内禁止进行任何破坏基本农田的活动，包括发展林果业。因此，如果流转的土地属于基本农田，则明确不可以种树。

2. 一般耕地

   • 合同约定优先：在土地流转合同中，如果明确约定了不得种树或规定了具体的土地用途，必须严格按照合同履行，不得擅自改变土地用途种树。否则，将构成违约并承担相应法律责任。
   • 符合土地利用规划：即使合同未对土地用途做出限制，种树也需符合当地的土地利用总体规划。若种树改变了土地的农业用途性质，与当地规划不符（如该区域被规划为粮食种植区），则不允许种树。相反，如果当地规划允许在一般耕地上适度发展林果业等特色农业，并且符合相关标准和要求，则可以种树。

3. 林地等其他农用地

   • 通常可种：如果流转的土地本身性质就是林地等适宜树木种植的农用地，那么通常是可以种树的。但在此过程中，仍需遵守林业相关法律法规，如涉及林木采伐等需办理相应许可证等手续。

二、流转合同约定

• 审查合同条款：在签订土地流转合同时，应仔细审查合同条款，特别是关于土地用途和限制的条款。如有不明确或疑问之处，应及时寻求法律解答，确保自己的权益不受侵害。
• 遵守合同约定：一旦合同签订，双方应严格遵守合同约定，不得擅自改变土地用途。如需变更合同内容，应协商一致并签订书面变更协议。

三、当地法律法规和政策

• 了解当地政策：不同地区对于土地流转和种植果树的政策可能有所不同。因此，在决定是否在流转的土地上种树之前，应了解当地的法律法规和政策要求。
• 遵守法律法规：无论何种情况，都应遵守国家法律法规和政策要求，确保流转行为的合法性和合规性。

四、综合建议

• 谨慎决策：在决定是否在流转的土地上种树之前，应综合考虑多方面因素，包括土地性质、合同约定、当地法律法规和政策等。切勿盲目决策，以免引发法律纠纷。
• 咨询法律意见：如有疑问或不确定之处，建议直接向我咨询。我可以根据具体情况提供针对性的法律分析和建议，帮助您做出合法合规的决策。

综上所述，土地流转后能否种树是一个复杂的问题，需要综合考虑多方面因素。通过仔细审查合同、了解当地法律法规和政策以及咨询法律意见，可以做出合法合规的决策。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我提问。