农民在自留地耕地种果树是否合法，需根据自留地的具体性质及当地法律法规和政策规定来判断。以下是对此问题的详细分析：
一、自留地性质与法律规定
自留地权属：
- 根据《中华人民共和国土地管理法》及相关规定，自留地属于农民集体所有，农民对自留地享有使用权，但这种使用权同样受到法律的限制，不得随意改变土地用途。
土地用途限制：
- 耕地，包括自留地中的耕地部分，原则上应优先用于粮食和农产品生产。这是基于国家粮食安全和耕地保护的政策导向。
二、种果树行为的合法性分析
永久基本农田上的禁止性规定：
- 如果自留地中的耕地被划定为永久基本农田，那么在该土地上种植果树是明确违法的。因为永久基本农田有严格的使用限制，原则上不得改变其用途用于发展林果业等。
一般耕地上的种树行为：
- 对于一般耕地，法律并未直接禁止种植果树，但应遵循相关规定并办理审批手续。若未经批准擅自种植，可能被视为擅自改变土地用途，从而构成违法行为。
- 此外，一些地方政府根据实际情况，为确保粮食种植面积，会出台相关政策对一般耕地上种植果树等行为进行规范和引导。因此，在具体操作时还需关注当地政策要求。
三、合法种树的条件与程序
合法审批：
- 若想在自留地耕地上种植果树，且该土地不属于永久基本农田，那么应按照相关规定进行申请和审批，获得批准后方可进行。审批程序可能包括向乡镇人民政府提交申请、经过县级人民政府批准等。
特定地区和政策：
- 在特定情况下，如山区、丘陵等不适宜大规模种植粮食作物的地区，当地政府可能会根据实际情况允许将部分耕地调整为经果林用地。但这同样需要遵循相关法律法规和政策要求，并办理相应的审批手续。
四、违法种树的法律责任
- 若违反规定在永久基本农田上种植果树或破坏了一般耕地的种植能力，将承担相应的法律责任。这可能包括罚款、恢复原状、赔偿损失等。在严重情况下，还可能构成犯罪，依法追究刑事责任。
五、建议与指导
- 了解当地政策：在决定在自留地耕地上种植果树之前，务必了解清楚当地的法律法规和政策规定，确保行为合法合规。
- 办理审批手续：如果符合种植条件并决定种植果树，应按照相关规定办理审批手续，避免因未经批准而构成违法行为。
- 咨询专业意见：如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，可以直接向我提问，我会根据你的具体情况提供准确的法律意见。
总结来说，农民在自留地耕地种果树是否合法，取决于自留地的具体性质、种植的树种以及是否符合当地政策和规划要求。因此，在进行此类活动前，应进行充分的法律咨询和审批流程，以避免可能的法律责任和处罚。