技术开发合同的知识产权归属问题，首先遵循“约定优先”原则，即合同中有明确约定的，按照合同约定执行；没有约定或约定不明确的，则依据相关法律法规进行判定。以下是对此问题的详细解析：
一、委托开发合同中的知识产权归属
专利申请权：
- 除非法律另有规定或当事人另有约定，委托开发完成的发明创造的专利申请权属于研究开发人。这意味着，在一般情况下，受托方（研究开发人）是专利申请权的所有者。
- 研究开发人取得专利权后，委托人有权依法实施该专利。这是委托方支付研发费用后应享有的基本权利。
- 若研究开发人转让专利申请权，委托人享有在同等条件下优先受让的权利。这保护了委托方的利益，防止技术成果被第三方轻易获取。
技术秘密成果：
- 委托开发完成的技术秘密成果的使用权、转让权及收益分配办法，由当事人约定。这体现了意思自治的原则，允许当事人根据自己的意愿来安排权利义务关系。
- 若无约定或约定不明确，且无法依据相关法律法规确定，则在相同技术方案未被授予专利权前，当事人均有使用和转让的权利。但重要的是，研究开发人在向委托人交付研究成果之前，不得将研究开发成果转让给第三人。这保护了委托方的利益，防止技术成果在交付前被泄露或转让。
二、合作开发合同中的知识产权归属
专利申请权：
- 合作开发完成的发明创造的专利申请权，除非当事人另有约定，否则属于合作开发的当事人共有。这是基于合作开发的性质，即各方均对技术研发做出了贡献，因此应共享研发成果。
- 当一方转让其共有的专利申请权时，其他各方享有在同等条件下优先受让的权利。这保护了合作方的利益，防止技术成果被外部第三方轻易获取。
- 若一方声明放弃其共有的专利申请权，除当事人另有约定外，可由另一方单独申请或由其他各方共同申请。此时，放弃方有权免费实施该专利。这体现了公平原则，既尊重了放弃方的意愿，又保护了其他合作方的利益。
- 若合作开发的一方不同意申请专利，则另一方或其他各方不得擅自申请。这防止了技术成果被部分合作方单独申请专利，从而损害其他合作方的利益。
技术秘密成果：
- 合作开发完成的技术秘密成果的使用权、转让权及收益分配办法，同样由当事人约定。这同样体现了意思自治的原则。
- 若无约定或约定不明确，且无法依据相关法律法规确定，则合作开发的当事人均有使用和转让的权利。这保证了合作方在技术成果上的平等权益。
三、特殊约定与后续改进
- 当事人可按照互利原则，在合同中约定实施专利、使用技术秘密及后续改进技术成果的分享办法。这允许当事人根据具体情况灵活安排权利义务关系。
- 若无此类约定或约定不明确，且无法依据相关法律法规确定，则一方后续改进的技术成果，其他各方无权分享。这保护了做出改进的一方的利益，鼓励其进行技术创新。
四、实际操作建议
- 在签订技术开发合同时，当事人应明确约定成果归属条款，以预防后续可能出现的纠纷。这包括专利申请权、专利权、技术秘密成果的使用权、转让权及收益分配办法等。
- 若发生纠纷，首先尝试通过协商解决；协商不成时，可通过仲裁或诉讼途径寻求法律救济。在仲裁或诉讼过程中，当事人应提供充分的证据来支持自己的主张。
举例说明：假设A公司委托B公司进行某项新技术的研发工作，双方签订了技术开发合同。合同中明确约定，研发成果的知识产权归B公司所有，但A公司有权在特定领域内使用该技术成果，并需向B公司支付一定的使用费。在这种情况下，即使A公司支付了全部的研发费用，但由于合同中的明确约定，技术成果的所有权仍然归属于B公司。
综上所述，技术开发合同中的知识产权归属问题涉及多个复杂的法律知识点。为确保各方权益得到妥善保护，当事人在签订合同前应充分了解并明确约定相关条款。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。