若未经您同意，别人擅自在自己承包的水库施工，这属于侵权行为，您有权要求对方停止施工、恢复原状并赔偿损失。以下从不同角度为您详细分析：

一、从物权保护角度

1. 物权保护原则：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，您作为水库的承包人，依法享有对水库的占有、使用、收益和处分的权利。未经您同意，他人擅自在水库施工，侵犯了您的物权。
2. 侵权责任：侵权人应当承担停止侵害、排除妨碍、消除危险、恢复原状、赔偿损失等民事责任。因此，您有权要求施工方立即停止施工，恢复水库原状，并赔偿因施工给您造成的损失。

二、从合同角度（如存在承包合同）

1. 合同约定：如果您与水库的所有者或管理者签订了承包合同，合同中可能明确规定了您对水库的使用权和管理权，以及禁止他人擅自施工等条款。
2. 违约责任：若施工方违反了合同中的相关条款，您还可以依据合同约定，要求施工方承担违约责任，包括但不限于支付违约金、赔偿损失等。

三、从行政法律角度

1. 行政许可与审批：如果施工行为涉及到水库的改造、扩建或改变用途等，可能需要经过相关行政部门的许可和审批。未经许可擅自施工，可能违反了行政法规的规定。
2. 行政处罚：对于未经许可擅自施工的行为，相关行政部门有权依法进行处罚，包括但不限于罚款、责令停止施工、恢复原状等。

四、建议采取的措施

1. 与施工方沟通：首先，您可以尝试与施工方进行沟通，明确告知其您的承包权和施工行为的违法性，要求其立即停止施工并恢复原状。
2. 收集证据：在沟通过程中，注意收集相关证据，如施工照片、视频、证人证言等，以备后续维权之需。
3. 寻求法律帮助：如果施工方拒绝停止施工或拒绝赔偿损失，您可以及时寻求法律帮助，通过法律途径维护自己的合法权益。

在处理此类问题时，请务必保持冷静和理性，依法维护自己的权益。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。