基本工资里包含加班工资是不合法的，这种行为侵害了劳动者的合法权益。以下从多个角度为你详细分析：

法律规定层面

根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的明确规定，用人单位在安排劳动者延长工作时间、休息日工作且不能安排补休、以及法定休假日工作时，需支付高于正常工作时间工资的工资报酬，具体标准如下：

1. 延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；
2. 休息日工作的，若不能安排补休，则支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；
3. 法定休假日工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。

这里的“工资”指的是劳动者在正常工作时间内应获得的报酬，即基本工资，而加班费是劳动者在超出正常工作时间外，因工作需要继续劳动所应获得的额外补偿。因此，将加班费包含在基本工资内，实际上是在未足额支付劳动者应得的加班费，违反了劳动法规。

加班费计算基数层面

“正常工作时间工资”是计算加班费的基础，它并非仅指基本工资，而是包含了基本工资、岗位津贴、补贴等相对固定的、在正常工作时间内劳动者应得的收入部分。在计算加班费时，应排除那些与工作成果挂钩、具有浮动性的部分（如绩效工资），但具体包括基本工资、岗位津贴等固定性收入。例如，某员工的月工资由基本工资3000元、岗位津贴1000元和绩效工资2000元组成，那么其加班费的计算基数应为基本工资与岗位津贴之和，即4000元，而非仅以基本工资3000元为准。

违法行为后果与劳动者权益保护

如果用人单位将基本工资包含加班费，实际上是在未足额支付劳动者应得的加班费，这严重侵害了劳动者的合法权益。对此，劳动者可以采取以下措施来维护自己的权益：

1. 劳动监察投诉：劳动者有权向当地劳动监察部门投诉，劳动监察部门将对用人单位进行调查，并根据调查结果责令用人单位支付拖欠的加班费，甚至可能对用人单位进行处罚。
2. 劳动仲裁与诉讼：若用人单位拒绝支付加班费，劳动者还可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求用人单位支付加班费及相应的经济补偿。如果对仲裁结果不满意，劳动者还可以进一步向人民法院提起诉讼，通过法律途径来维护自己的合法权益。

实例说明

假设小李的月基本工资为4000元，本月他加班了10个小时（其中平时加班5小时，休息日加班5小时且不能安排补休）。按照法律规定，公司应按照小李的正常小时工资标准的1.5倍（平时加班）和2倍（休息日加班）支付加班费。如果公司声称这4000元已经包含了加班费，那么这显然是不符合法律规定的。小李有权要求公司按照其正常小时工资标准额外支付加班工资，具体计算方式如下：

• 平时加班工资：\(月工资\div21.75\div8\times加班小时数\times1.5倍\)，即\(4000\div21.75\div8\times5\times1.5\approx172.41\)元；
• 休息日加班工资：\(月工资\div21.75\div8\times加班小时数\times2倍\)，即\(4000\div21.75\div8\times5\times2\approx229.89\)元；
• 小李应得加班工资总额：\(172.41+229.89=402.3\)元。

如果公司未支付这402.3元的加班工资，小李就有权通过上述途径来维护自己的权益。

综上所述，基本工资包含加班费是违法的，劳动者应了解自己的合法权益，并在遇到此类情况时采取适当的措施来维护自己的权益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。